More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2168 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
360 aa  741    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  51.36 
 
 
312 aa  296  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  40.48 
 
 
297 aa  258  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  40.48 
 
 
297 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  39.27 
 
 
296 aa  236  6e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  38.49 
 
 
705 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  39.39 
 
 
299 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  36.53 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  37.79 
 
 
306 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  34.06 
 
 
652 aa  175  9e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  37.83 
 
 
299 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.25 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  36.59 
 
 
308 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  36.82 
 
 
311 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 
289 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  34.85 
 
 
313 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 
312 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  32.95 
 
 
387 aa  145  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
324 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  34.9 
 
 
336 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2391  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
282 aa  143  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.337746  normal  0.474802 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  37.45 
 
 
318 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
310 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  37.13 
 
 
318 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  37.45 
 
 
318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 
324 aa  139  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  34.6 
 
 
311 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
318 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  35.97 
 
 
282 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
324 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
293 aa  136  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  33.72 
 
 
306 aa  135  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  35.95 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
327 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.38 
 
 
379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0558  glycosyl transferase family 2  28.98 
 
 
279 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863042  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 
310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.34 
 
 
311 aa  126  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 
361 aa  125  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 
304 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 
340 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  34.18 
 
 
324 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 
307 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
329 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 
313 aa  123  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
314 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
331 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 
342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1249  glycosyl transferase  32.29 
 
 
275 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1219  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
275 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.428258  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 
321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
298 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
318 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02692  glycosyl transferase  30.58 
 
 
279 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 
1523 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
296 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 
1523 aa  113  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
296 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
296 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
415 aa  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
318 aa  113  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  30.31 
 
 
284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
270 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 
333 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0965  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
275 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.253321  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
307 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
679 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  30.15 
 
 
301 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
303 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
624 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
274 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.51 
 
 
315 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
315 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 
300 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
306 aa  105  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 
337 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
346 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
290 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
1340 aa  103  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 
336 aa  103  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  29.89 
 
 
320 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
330 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 
301 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>