281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2160 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 236 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  47.58 
 
 		 261 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  49.78 
 
 		 258 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  48.23 
 
 		 258 aa  204  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  48.67 
 
 		 261 aa  204  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  49.78 
 
 		 261 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  49.35 
 
 		 258 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  48.92 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  48.48 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  52.2 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  50.88 
 
 		 258 aa  188  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  50.88 
 
 		 258 aa  188  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  41.56 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  48 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  43.72 
 
 		 258 aa  174  8e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  45.54 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  45.54 
 
 		 265 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  40.69 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  45.54 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  42.86 
 
 		 265 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  42.86 
 
 		 265 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  42.86 
 
 		 265 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  42.86 
 
 		 265 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  45.07 
 
 		 265 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  45.07 
 
 		 265 aa  170  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  41.78 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  40.38 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  41.26 
 
 		 260 aa  162  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  39.32 
 
 		 263 aa  162  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  38.96 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  44.9 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  38.96 
 
 		 256 aa  161  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  40.38 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  42.79 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  40.44 
 
 		 262 aa  158  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  39.72 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  40.19 
 
 		 267 aa  154  8e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  36.4 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  40.44 
 
 		 259 aa  151  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1630  flagellar biosynthesis protein FliR  40.85 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  39.47 
 
 		 259 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  39.47 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4424  flagellar biosynthetic protein FliR  40.09 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.926319 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  42.06 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  40 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  40.19 
 
 		 260 aa  144  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  40.19 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001178  flagellar biosynthesis protein FliR  38.84 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.795861  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04965  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  36.75 
 
 		 258 aa  141  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  39.53 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2296  flagellar biosynthesis protein FliR  43 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  37.86 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  38.83 
 
 		 260 aa  138  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  37.39 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  40.62 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  36.89 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  36.68 
 
 		 265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  35.75 
 
 		 261 aa  134  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  34.65 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  36.36 
 
 		 264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  36.89 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  36.61 
 
 		 257 aa  132  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  35.9 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  37.05 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  37.05 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  35.45 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  35.45 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  35.45 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  39.13 
 
 		 265 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  37.95 
 
 		 264 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  37.95 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  37.95 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  37.95 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  37.95 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  32.89 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  34.23 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  37.24 
 
 		 262 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  37.93 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00968  flagellar biosynthetic protein FliR  36.79 
 
 		 257 aa  124  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0109707  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06198  flagellar biosynthetic protein FliR  36.79 
 
 		 257 aa  124  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.305081  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  41.97 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0243  lateral flagellar export/assembly protein LfiR  33.47 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3389  flagellar biosynthetic protein FliR  33.47 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  36.24 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  35.91 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  37.24 
 
 		 262 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  34.7 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  33.78 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  36.92 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  36.92 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  33.78 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  37.24 
 
 		 262 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  36.24 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  34.76 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  33.78 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  33.78 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  33.78 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  33.78 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  33.78 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1564  flagellar biosynthetic protein FliR  37.95 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>