117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2060 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2060  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  476  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000547125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3238  putative transcriptional regulator  37.56 
 
 		 211 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1246  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  34.33 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0028  transcriptional regulator  32.68 
 
 		 217 aa  101  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.572077  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1570  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 		 219 aa  99.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.417601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3558  putative transcriptional regulator  30.2 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5538  putative transcriptional regulator  29.81 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.912326  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3451  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 		 217 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  hitchhiker  0.00000000543336 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1134  putative transcriptional regulator  33.49 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  0.0484804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2549  transcriptional regulator  36.18 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  31.98 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4686  DeoR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000645179  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0896  putative transcriptional regulator  30.46 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3358  putative transcriptional regulator  29.7 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338727  normal  0.270871 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4828  DeoR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00756639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4669  DeoR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5193  DeoR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.076054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5102  transcriptional regulator, DeoR family  26.73 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5064  transcriptional regulator, DeoR family  27.23 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2493  putative transcriptional regulator  31.5 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117208  normal  0.769487 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001755  predicted transcriptional regulator  28.79 
 
 		 206 aa  92.4  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0303  transcriptional regulator, TrmB  32.51 
 
 		 209 aa  91.7  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1711  putative transcriptional regulator  30.58 
 
 		 210 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.42173  normal  0.540015 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5103  transcriptional regulator, DeoR family  26.73 
 
 		 210 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0435  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 199 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.341746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5988  putative transcriptional regulator  31.86 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0414  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0425  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.973468  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5097  DeoR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2239  hypothetical protein  29 
 
 		 205 aa  89.4  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0136  transcriptional regulator, DeoR family  26.24 
 
 		 210 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.790585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00716  hypothetical protein  27 
 
 		 204 aa  89  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1048  putative transcriptional regulator  29.86 
 
 		 207 aa  88.2  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4781  putative transcriptional regulator  27.23 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4997  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4804  putative transcriptional regulator  31.07 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000646734 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  32.31 
 
 		 280 aa  85.9  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1973  putative transcriptional regulator  31.53 
 
 		 254 aa  85.1  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2786  putative transcriptional regulator  31.71 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4354  transcriptional regulator  28.64 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1452  putative transcriptional regulator  28.43 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0888  putative transcriptional regulator  30.39 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2262  putative transcriptional regulator  32.37 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2543  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3070  transcriptional regulator, TrmB  27.4 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0995  hypothetical protein  29.06 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1018  putative transcriptional regulator  26.54 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0091  hypothetical protein  25.98 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2681  putative transcriptional regulator  30.1 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381379  normal  0.0939386 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4801  putative transcriptional regulator  32.52 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472031 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1113  putative transcriptional regulator  26.34 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0915  putative transcriptional regulator  27.19 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.949391 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3278  putative transcriptional regulator  26.34 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0971152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  27.69 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2275  putative transcriptional regulator  31.22 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171437  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2964  putative transcriptional regulator  31.07 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1080  putative transcriptional regulator  26.34 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2223  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000435551  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14610  predicted transcriptional regulator  26.64 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0307  putative transcriptional regulator  28.92 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.519243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2175  transcriptional regulator TrmB  29.95 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168136  normal  0.574645 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1988  transcriptional regulator  31.08 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.625652  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1011  putative transcriptional regulator  26.34 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5155  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3584  hypothetical protein  28.23 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1733  transcriptional regulator  26.21 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.86463 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3079  transcriptional regulator  26.11 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0625169  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3176  transcriptional regulator  26.11 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4136  hypothetical protein  28.37 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3788  hypothetical protein  28.37 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2998  transcriptional regulator  26.11 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00441752  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0414  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.802259  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2382  regulatory protein ArsR  26.29 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.307498  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2510  putative transcriptional regulator  28.97 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0018  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3311  putative transcriptional regulator  28.69 
 
 		 251 aa  72  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000054847 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2819  putative transcriptional regulator  29.85 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16120  transcriptional regulator  31.22 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.778634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2471  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3084  regulatory protein, ArsR  27.85 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00550431  normal  0.268013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2435  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2480  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2387  transcriptional regulator protein-like protein  27.5 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.328356  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2732  putative transcriptional regulator  29.22 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0409175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0423  transcriptional regulator  25.35 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956901  normal  0.107177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4139  putative transcriptional regulator  28.77 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.936463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2441  putative transcriptional regulator  29.3 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.125946 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1356  putative transcriptional regulator  28.37 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1166  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1289  hypothetical protein  26.5 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1043  hypothetical protein  26.5 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0077  transcriptional regulator  26.5 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.53122  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0030  hypothetical protein  26.5 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0384  hypothetical protein  26.5 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1579  hypothetical protein  26.5 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1494  hypothetical protein  26.5 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1200  hypothetical protein  26.5 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108281  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3678  putative transcriptional regulator  31.05 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11488  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0037779  normal  0.99088 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>