More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2003 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  100 
 
 
505 aa  1009    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  62.38 
 
 
506 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  61.6 
 
 
496 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  63.51 
 
 
485 aa  594  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  59 
 
 
498 aa  585  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  62.35 
 
 
510 aa  579  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  60.31 
 
 
512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0331  competence-related protein  57.68 
 
 
509 aa  576  1.0000000000000001e-163  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  59.06 
 
 
513 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  61.34 
 
 
504 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  60.12 
 
 
510 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  61.37 
 
 
497 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  56.69 
 
 
509 aa  568  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  57.74 
 
 
507 aa  568  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  58.76 
 
 
506 aa  566  1e-160  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  60.28 
 
 
497 aa  566  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  61.24 
 
 
498 aa  562  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  56.35 
 
 
507 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0042  putative competence protein  57.62 
 
 
508 aa  565  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.744278  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  58.57 
 
 
506 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  58.87 
 
 
497 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  56.44 
 
 
507 aa  559  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  58.73 
 
 
507 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4252  Mg chelatase, subunit ChlI  56.35 
 
 
516 aa  558  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  55.69 
 
 
508 aa  552  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  59.48 
 
 
496 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0338  Mg(2+) chelatase family protein  58.66 
 
 
510 aa  545  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0136  Mg chelatase, subunit ChlI  55.73 
 
 
508 aa  546  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  61.17 
 
 
495 aa  546  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  58.72 
 
 
501 aa  540  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  54.05 
 
 
530 aa  536  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3092  Mg chelatase-related protein  62.84 
 
 
525 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4016  putative ATP-dependent protease  54.67 
 
 
506 aa  534  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0359252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0082  Mg chelatase, subunit ChlI  60.56 
 
 
505 aa  532  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361038  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4033  Mg chelatase, subunit ChlI  54.72 
 
 
508 aa  533  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4223  Mg chelatase, subunit ChlI  54.65 
 
 
508 aa  534  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3653  Mg chelatase, subunit ChlI  54.96 
 
 
503 aa  530  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5239  magnesium chelatase subunit D/I family protein  59.56 
 
 
496 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3220  Mg chelatase, subunit D/I family protein  55.07 
 
 
528 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0197  Mg chelatase-related protein  59.64 
 
 
497 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0648  Mg chelatase-like protein  55.07 
 
 
528 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0466  putative Mg chelatase  54.88 
 
 
528 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1398  Mg chelatase, subunit D/I family protein  55.07 
 
 
528 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0405  Mg chelatase-related protein  55.34 
 
 
526 aa  527  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3782  Mg chelatase, subunit ChlI  61.26 
 
 
499 aa  528  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.121114  normal  0.616165 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2825  Mg chelatase, subunit D/I family protein  55.07 
 
 
528 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5149  Mg chelatase, subunit ChlI  59.76 
 
 
496 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0195  Mg chelatase, subunit D/I family protein  55.07 
 
 
528 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2393  Mg chelatase, subunit ChlI  56.1 
 
 
503 aa  526  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0485  putative Mg chelatase  55.07 
 
 
528 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428231  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5300  Mg chelatase, subunit ChlI  59.15 
 
 
496 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.787159 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0481  Mg chelatase-like protein  54.65 
 
 
507 aa  523  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  54.35 
 
 
510 aa  522  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0153  Mg chelatase-like protein  54.65 
 
 
507 aa  524  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4062  Mg chelatase, subunit ChlI  54.65 
 
 
507 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0435  Mg chelatase, subunit ChlI  54.6 
 
 
538 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0523  Mg chelatase, subunit ChlI  55.04 
 
 
532 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887064  normal  0.860383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4192  Mg chelatase-related protein  55.15 
 
 
529 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  54.44 
 
 
509 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2785  Mg chelatase, subunit ChlI  54.68 
 
 
528 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2923  Mg chelatase, subunit ChlI  53.86 
 
 
536 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466076  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0410  Mg chelatase, subunit ChlI  51.19 
 
 
507 aa  512  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2879  Mg chelatase, subunit ChlI  54.06 
 
 
534 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4133  putative ATP-dependent protease  51.59 
 
 
506 aa  512  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.815544  normal  0.463834 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2447  Mg chelatase-related protein  51.64 
 
 
516 aa  512  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4231  putative ATP-dependent protease  52.38 
 
 
506 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2254  Mg chelatase-related protein  54.06 
 
 
534 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.049586  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4290  putative ATP-dependent protease  51.98 
 
 
506 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4110  putative ATP-dependent protease  52.18 
 
 
506 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4182  putative ATP-dependent protease  52.38 
 
 
506 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2868  Mg chelatase, subunit ChlI  54.06 
 
 
534 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169459  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  56.18 
 
 
504 aa  514  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4125  putative ATP-dependent protease  52.38 
 
 
506 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5201  putative ATP-dependent protease  51.19 
 
 
506 aa  508  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2125  magnesium chelatase-related protein  52.31 
 
 
516 aa  511  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.69723  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0202  Mg chelatase-related protein  52.69 
 
 
511 aa  510  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3983  putative ATP-dependent protease  51.39 
 
 
506 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4278  putative ATP-dependent protease  51.39 
 
 
506 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4236  putative ATP-dependent protease  51.39 
 
 
506 aa  509  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250822  normal  0.127263 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  52.67 
 
 
506 aa  510  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0321513 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03644  predicted bifunctional enzyme and transcriptional regulator  51.19 
 
 
516 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104789  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4209  Mg chelatase, subunit ChlI  51.19 
 
 
506 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03593  hypothetical protein  51.19 
 
 
516 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3940  Mg chelatase, subunit ChlI  51.77 
 
 
508 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3820  Mg chelatase, subunit ChlI  52.17 
 
 
508 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  50.2 
 
 
506 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4135  Mg chelatase, subunit ChlI  51.38 
 
 
508 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0349  magnesium chelatase family protein  51.57 
 
 
508 aa  504  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3639  Mg chelatase, subunit ChlI  52.17 
 
 
509 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4042  Mg chelatase, subunit ChlI  51.38 
 
 
508 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4016  Mg chelatase, subunit ChlI  51.38 
 
 
508 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3624  Mg chelatase, subunit ChlI  52.17 
 
 
508 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  52.17 
 
 
508 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  52.88 
 
 
517 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0181  Mg chelatase-related protein  53.55 
 
 
523 aa  500  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0597  Mg chelatase, subunit ChlI  58.84 
 
 
529 aa  501  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0231  Mg chelatase, subunit ChlI  53.08 
 
 
517 aa  501  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  50.49 
 
 
509 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  53.7 
 
 
515 aa  498  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4171  Mg chelatase, subunit ChlI  50.4 
 
 
507 aa  496  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>