More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1973 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
416 aa  841    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  55.42 
 
 
405 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  57.07 
 
 
405 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  57.25 
 
 
411 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  54.61 
 
 
406 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  54.32 
 
 
406 aa  443  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  52.78 
 
 
405 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  51.24 
 
 
401 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  54.73 
 
 
402 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4821  glycosyl transferase, group 1  53.5 
 
 
401 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726751  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  48.39 
 
 
405 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  55.36 
 
 
768 aa  311  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  35.41 
 
 
1188 aa  196  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  32.28 
 
 
723 aa  196  6e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  33.81 
 
 
564 aa  186  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  32.76 
 
 
557 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  33 
 
 
569 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4282  glycosyl transferase, group 1  32.01 
 
 
396 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 
575 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0635  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
403 aa  169  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08970  glycosyltransferase  32.37 
 
 
601 aa  158  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1851  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.98 
 
 
400 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26850  glycosyltransferase  36.01 
 
 
573 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  35.41 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  35.41 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27990  glycosyltransferase  29.95 
 
 
603 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  26.01 
 
 
416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 
414 aa  125  9e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
411 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  33.48 
 
 
446 aa  116  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
536 aa  113  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
408 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
412 aa  110  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
415 aa  110  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 
360 aa  110  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 
435 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  29.11 
 
 
408 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 
386 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
386 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
412 aa  106  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
360 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  25 
 
 
404 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
535 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
359 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
434 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.73 
 
 
377 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
403 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
672 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 
420 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
410 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
417 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
413 aa  103  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
904 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
377 aa  103  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  32.44 
 
 
399 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  25.08 
 
 
371 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
410 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
436 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
440 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  24.09 
 
 
394 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
415 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
392 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 
389 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  26.94 
 
 
406 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
388 aa  99.8  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
408 aa  99.4  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
402 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  29.23 
 
 
935 aa  99.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
414 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
810 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  28.97 
 
 
392 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
399 aa  97.8  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 
439 aa  97.8  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 
404 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
419 aa  97.8  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
418 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
398 aa  97.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
395 aa  97.4  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
378 aa  97.1  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
378 aa  97.1  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 
365 aa  97.1  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
383 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  32.57 
 
 
346 aa  96.3  8e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1513  group 1 glycosyl transferase  29.46 
 
 
349 aa  96.7  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42388  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
389 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
381 aa  95.5  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
402 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 
417 aa  95.9  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 
426 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  27.04 
 
 
383 aa  95.5  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
378 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0701  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
371 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>