136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1942 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
491 aa  958    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  29.87 
 
 
483 aa  242  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  32.98 
 
 
472 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  28.21 
 
 
492 aa  209  9e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  33.05 
 
 
490 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  26.83 
 
 
488 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  30.53 
 
 
504 aa  173  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  28.1 
 
 
482 aa  155  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3381  polysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 
494 aa  140  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0051743  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0143  polysaccharide biosynthesis protein  27.06 
 
 
477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712292  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0429  polysaccharide biosynthesis protein  27.73 
 
 
497 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 
479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.62 
 
 
476 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  22.42 
 
 
487 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3348  polysaccharide biosynthesis protein  29.9 
 
 
502 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 
486 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  21.91 
 
 
490 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  21.35 
 
 
479 aa  107  7e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
489 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 
487 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 
502 aa  104  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 
484 aa  104  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  25.38 
 
 
501 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  25.69 
 
 
501 aa  103  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  26.77 
 
 
510 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  26.77 
 
 
510 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 
475 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 
507 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  26.68 
 
 
482 aa  101  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  28.44 
 
 
503 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  27.81 
 
 
490 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 
480 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 
487 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  27.07 
 
 
488 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  21.56 
 
 
483 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  24.58 
 
 
493 aa  90.5  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  26.61 
 
 
488 aa  89.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  25.86 
 
 
509 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 
484 aa  88.2  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 
510 aa  87.8  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  24.15 
 
 
497 aa  87.4  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  19.88 
 
 
492 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  19.88 
 
 
492 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 
501 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  21.53 
 
 
492 aa  86.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  20.08 
 
 
492 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  20.08 
 
 
492 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  19.88 
 
 
492 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  20.65 
 
 
492 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  28.16 
 
 
503 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  19.88 
 
 
492 aa  84.3  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  21.36 
 
 
474 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  21.36 
 
 
475 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  23.29 
 
 
483 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 
503 aa  82.8  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  19.96 
 
 
492 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 
423 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 
482 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  28.89 
 
 
507 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 
508 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  27.83 
 
 
494 aa  80.9  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 
520 aa  80.1  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  27.58 
 
 
492 aa  77.8  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 
499 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  25.39 
 
 
500 aa  77.4  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  20.65 
 
 
510 aa  76.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 
497 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  20.65 
 
 
510 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  20.65 
 
 
510 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  20.65 
 
 
503 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  20.65 
 
 
510 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3528  polysaccharide biosynthesis protein  25.21 
 
 
481 aa  75.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000418203  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  21.82 
 
 
472 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  20.75 
 
 
483 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 
514 aa  73.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  22.99 
 
 
490 aa  73.9  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  24.66 
 
 
504 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  23.01 
 
 
509 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  21.07 
 
 
497 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  23.81 
 
 
483 aa  71.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 
504 aa  71.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  25.17 
 
 
471 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 
498 aa  70.1  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  22.95 
 
 
505 aa  69.3  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  23.25 
 
 
533 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 
498 aa  67.4  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 
515 aa  67  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  23.28 
 
 
502 aa  66.6  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  29.46 
 
 
575 aa  66.6  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  21.5 
 
 
512 aa  66.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  25.57 
 
 
506 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 
493 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.11 
 
 
508 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 
500 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 
504 aa  65.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 
493 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 
500 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 
530 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 
502 aa  63.2  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>