More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1840 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  100 
 
 		 453 aa  895    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  52.03 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  49.21 
 
 		 453 aa  395  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  48.69 
 
 		 422 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  46.14 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  45.03 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  44.81 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  45.23 
 
 		 454 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  45.23 
 
 		 454 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  45.45 
 
 		 454 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  45.68 
 
 		 454 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  45 
 
 		 454 aa  385  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  44.37 
 
 		 454 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  44.71 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  45.11 
 
 		 452 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  47.88 
 
 		 452 aa  381  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  45 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  45 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  44.77 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  45 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  47.57 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  45.68 
 
 		 453 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  41.56 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  47.48 
 
 		 450 aa  368  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  41.89 
 
 		 452 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  44.55 
 
 		 453 aa  365  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  43.82 
 
 		 451 aa  362  8e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  46.03 
 
 		 480 aa  361  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  42.92 
 
 		 452 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  43.82 
 
 		 451 aa  356  5e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  43.98 
 
 		 479 aa  350  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  43.68 
 
 		 454 aa  350  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  46.47 
 
 		 450 aa  349  6e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  42.76 
 
 		 480 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  42.76 
 
 		 480 aa  345  8e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  42.32 
 
 		 480 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  42.32 
 
 		 480 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  42.67 
 
 		 480 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  44.32 
 
 		 481 aa  343  4e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  43.95 
 
 		 452 aa  343  5e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  43.53 
 
 		 480 aa  343  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  42.92 
 
 		 480 aa  343  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  43.09 
 
 		 482 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  43.09 
 
 		 482 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  43.06 
 
 		 480 aa  340  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  46.21 
 
 		 455 aa  336  3.9999999999999995e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  43.21 
 
 		 480 aa  329  6e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  40.47 
 
 		 481 aa  311  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  41.57 
 
 		 494 aa  311  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  41.63 
 
 		 475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  38.29 
 
 		 478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  38.7 
 
 		 492 aa  302  7.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  41.88 
 
 		 478 aa  302  8.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  39.66 
 
 		 491 aa  302  9e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  39.66 
 
 		 491 aa  302  9e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  39.66 
 
 		 491 aa  302  9e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  39.77 
 
 		 477 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  36.82 
 
 		 446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  40.24 
 
 		 476 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  35.68 
 
 		 445 aa  278  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  37.5 
 
 		 492 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  37.88 
 
 		 465 aa  275  9e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  37.18 
 
 		 456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  37.18 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  37.03 
 
 		 458 aa  273  6e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  36.94 
 
 		 456 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  37.18 
 
 		 456 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  36.54 
 
 		 492 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  36.71 
 
 		 484 aa  269  7e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  37.41 
 
 		 454 aa  265  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  37.77 
 
 		 463 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  36.1 
 
 		 467 aa  263  6e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  36.78 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  37.41 
 
 		 456 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  37.41 
 
 		 456 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  37.41 
 
 		 456 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  34.91 
 
 		 455 aa  260  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  37.41 
 
 		 456 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  35.08 
 
 		 443 aa  260  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0262  MgtE intracellular region  36.27 
 
 		 445 aa  257  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4045  magnesium transporter  36.32 
 
 		 472 aa  256  7e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  37.32 
 
 		 471 aa  256  7e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2758  MgtE integral membrane region  35.5 
 
 		 448 aa  256  7e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  36.07 
 
 		 462 aa  254  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  35.71 
 
 		 471 aa  250  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  34.33 
 
 		 473 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  35.24 
 
 		 481 aa  246  6e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  37.59 
 
 		 470 aa  246  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  38.18 
 
 		 461 aa  245  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  35.24 
 
 		 473 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  37.23 
 
 		 462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0416  putative magnesium transporter MgtE  35.38 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  36.52 
 
 		 471 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  35.48 
 
 		 471 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  35.71 
 
 		 471 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  33.63 
 
 		 470 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  34 
 
 		 481 aa  236  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  33.72 
 
 		 459 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  33.72 
 
 		 444 aa  236  7e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  33.85 
 
 		 445 aa  235  9e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>