More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1809 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  100 
 
 
849 aa  1764    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  80.93 
 
 
570 aa  890    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  68.21 
 
 
568 aa  759    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  69 
 
 
569 aa  769    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4240  N-6 DNA methylase  56.11 
 
 
567 aa  597  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386659  hitchhiker  0.00142847 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  55.74 
 
 
567 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  54.71 
 
 
544 aa  570  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  54.06 
 
 
519 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  55.14 
 
 
540 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  52.93 
 
 
528 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  53.33 
 
 
523 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  45.14 
 
 
532 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  51.97 
 
 
535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  52.42 
 
 
517 aa  449  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  52.33 
 
 
576 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  43.94 
 
 
525 aa  445  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  43.94 
 
 
525 aa  445  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  42.54 
 
 
520 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  45.25 
 
 
538 aa  434  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  44.42 
 
 
518 aa  435  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  44.92 
 
 
521 aa  433  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  44.47 
 
 
527 aa  431  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  45.54 
 
 
511 aa  432  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  43.61 
 
 
519 aa  423  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  45.49 
 
 
540 aa  420  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  44.74 
 
 
544 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  50.58 
 
 
501 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  50.35 
 
 
501 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  43.86 
 
 
497 aa  415  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  41.31 
 
 
539 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  42.53 
 
 
518 aa  414  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  43.28 
 
 
549 aa  411  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  41.95 
 
 
544 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  43.5 
 
 
514 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  41.28 
 
 
529 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  41.54 
 
 
529 aa  406  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  42.19 
 
 
517 aa  406  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  43.38 
 
 
540 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  43.13 
 
 
515 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  42.41 
 
 
541 aa  401  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  41.08 
 
 
564 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  48.24 
 
 
498 aa  399  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  41.87 
 
 
540 aa  396  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  41.13 
 
 
510 aa  393  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  42.57 
 
 
543 aa  392  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  42.21 
 
 
548 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  46.45 
 
 
527 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3300  N-6 DNA methylase  42.48 
 
 
537 aa  385  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  45.54 
 
 
503 aa  378  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  44.76 
 
 
500 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  32.57 
 
 
510 aa  272  2e-71  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1221  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  31.45 
 
 
533 aa  246  9e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  33.78 
 
 
574 aa  244  7e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  34.46 
 
 
574 aa  243  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2666  type I restriction-modification system specificity subunit  35.2 
 
 
508 aa  241  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289078  normal  0.157244 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  33.26 
 
 
587 aa  241  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  33.26 
 
 
574 aa  240  8e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0022  N-6 DNA methylase  35.25 
 
 
495 aa  238  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0030  N-6 DNA methylase  35.25 
 
 
495 aa  238  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0191758 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  33.94 
 
 
495 aa  228  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2236  N-6 DNA methylase  31.64 
 
 
528 aa  228  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  32.21 
 
 
814 aa  224  6e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0004  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32.88 
 
 
517 aa  223  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0065  N4/N6-methyltransferase family protein  49.57 
 
 
255 aa  219  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1303  N-6 DNA methylase  33.95 
 
 
529 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1712  N-6 DNA methylase  30.54 
 
 
662 aa  218  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.857909  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2329  N-6 DNA methylase  33.26 
 
 
538 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  32.73 
 
 
815 aa  215  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  31.29 
 
 
633 aa  214  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3498  N-6 DNA methylase  33.26 
 
 
694 aa  213  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  30.99 
 
 
585 aa  212  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  31.18 
 
 
822 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2469  N-6 DNA methylase  28.74 
 
 
772 aa  209  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  30.96 
 
 
808 aa  206  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  32.81 
 
 
505 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  31.47 
 
 
523 aa  203  9e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  31.24 
 
 
495 aa  203  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  30.79 
 
 
860 aa  203  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  31.47 
 
 
508 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2365  N-6 DNA methylase  32.05 
 
 
526 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.725173  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0154  site-specific DNA-methyltransferase, type I modification  48.71 
 
 
234 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  30.44 
 
 
891 aa  197  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  31.18 
 
 
501 aa  197  8.000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  31.46 
 
 
498 aa  197  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  29.56 
 
 
522 aa  196  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  32.04 
 
 
500 aa  195  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  29.26 
 
 
527 aa  195  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  28.91 
 
 
506 aa  193  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  31.97 
 
 
498 aa  193  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  30.3 
 
 
568 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4352  N-6 DNA methylase  28.8 
 
 
565 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  31.25 
 
 
516 aa  190  9e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  30.59 
 
 
526 aa  190  9e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  29.89 
 
 
504 aa  189  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  30.91 
 
 
496 aa  189  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  29.49 
 
 
816 aa  188  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  29.93 
 
 
505 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  31.19 
 
 
908 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  30.22 
 
 
511 aa  185  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  29.69 
 
 
499 aa  183  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>