More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1770 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  100 
 
 		 405 aa  784    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1279  sodium:dicarboxylate symporter  50.35 
 
 		 441 aa  364  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0428035  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  48.68 
 
 		 432 aa  354  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  45 
 
 		 425 aa  277  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  41.56 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  41.56 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  41.56 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0917  Sodium:dicarboxylate symporter  44.31 
 
 		 420 aa  268  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0420042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  41.06 
 
 		 444 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  41.67 
 
 		 427 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  40.4 
 
 		 424 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  41.65 
 
 		 430 aa  263  6e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  39.9 
 
 		 440 aa  259  8e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  39.47 
 
 		 439 aa  258  9e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  39.9 
 
 		 440 aa  258  9e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  41.37 
 
 		 436 aa  258  9e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  39.9 
 
 		 435 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  40.62 
 
 		 433 aa  257  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  41.1 
 
 		 436 aa  257  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  41.3 
 
 		 442 aa  257  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  37.28 
 
 		 440 aa  256  7e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  41.64 
 
 		 437 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  39.49 
 
 		 413 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  39.51 
 
 		 437 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  40.86 
 
 		 402 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  41.37 
 
 		 437 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  41.37 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  41.1 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  39.69 
 
 		 432 aa  250  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  41.1 
 
 		 440 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  41.1 
 
 		 440 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  41.1 
 
 		 436 aa  250  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  40.41 
 
 		 449 aa  249  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  40.82 
 
 		 437 aa  249  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  36.96 
 
 		 433 aa  249  6e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  40.71 
 
 		 441 aa  249  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  40.89 
 
 		 437 aa  249  8e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  37.59 
 
 		 434 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  43.01 
 
 		 417 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  37.44 
 
 		 445 aa  247  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  39.34 
 
 		 409 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  36.96 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  39.67 
 
 		 410 aa  241  1e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6400  sodium:dicarboxylate symporter  41.71 
 
 		 470 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  39.67 
 
 		 411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  39.67 
 
 		 411 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.46 
 
 		 437 aa  239  8e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  37.65 
 
 		 411 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  41.49 
 
 		 425 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  37.16 
 
 		 434 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  39.4 
 
 		 411 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  39.4 
 
 		 411 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  39.4 
 
 		 411 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  39.4 
 
 		 411 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  39.4 
 
 		 411 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  39.13 
 
 		 411 aa  236  8e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  38.36 
 
 		 449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  38.86 
 
 		 411 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  39.02 
 
 		 411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  38.07 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  34.66 
 
 		 423 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  34.41 
 
 		 423 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  34.41 
 
 		 423 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  34.41 
 
 		 423 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  35.14 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  34.41 
 
 		 423 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  33.08 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  34.41 
 
 		 423 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  40.53 
 
 		 422 aa  227  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  41.8 
 
 		 438 aa  226  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  34.16 
 
 		 423 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  34.16 
 
 		 423 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  34.89 
 
 		 457 aa  226  6e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  34.09 
 
 		 422 aa  226  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  33.92 
 
 		 423 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  39.25 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3042  sodium:dicarboxylate symporter  39.29 
 
 		 424 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2948  sodium:dicarboxylate symporter  39.29 
 
 		 424 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00484228  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2861  Sodium/dicarboxylate symporter  40.67 
 
 		 424 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0942349  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  37.84 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  37.53 
 
 		 452 aa  220  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  35.21 
 
 		 481 aa  220  3e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  40.78 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1993  Sodium:dicarboxylate symporter  34.6 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  32.28 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  32.28 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  32.28 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  32.28 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  32.28 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  32.28 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2071  sodium:dicarboxylate symporter  37.75 
 
 		 431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.840626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  32.28 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  32.28 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  38.14 
 
 		 444 aa  216  4e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  32.28 
 
 		 437 aa  216  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  35.37 
 
 		 444 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  40.27 
 
 		 436 aa  216  8e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  30.73 
 
 		 437 aa  215  9e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  34.85 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>