More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1745 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1745  oxidoreductase  100 
 
 		 372 aa  777    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1774  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  70.86 
 
 		 367 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2115  radical SAM domain protein  70.86 
 
 		 367 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2560  radical SAM family protein  65.58 
 
 		 369 aa  530  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0538253  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20630  MoaA, NifB, PqqE, radical SAM superfamily protein  65.22 
 
 		 377 aa  528  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0060  radical SAM family protein  67.63 
 
 		 387 aa  512  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0850532  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0815  MoaA/NifB/PqqE family protein  65.18 
 
 		 371 aa  510  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3055  radical SAM domain-containing protein  65.9 
 
 		 386 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1963  radical SAM domain-containing protein  65.9 
 
 		 386 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0981  radical SAM domain-containing protein  65.9 
 
 		 386 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820842  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2930  radical SAM domain-containing protein  65.9 
 
 		 386 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1268  radical SAM domain-containing protein  65.9 
 
 		 386 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2243  radical SAM domain-containing protein  65.9 
 
 		 386 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4899  radical SAM family protein  64.23 
 
 		 386 aa  498  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152748  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0105  radical SAM oxidoreductase  65.62 
 
 		 386 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4168  putative hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein  64.18 
 
 		 388 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159717  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0017  MoaA/NifB/PqqE family protein  64.47 
 
 		 384 aa  494  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3252  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  65.23 
 
 		 386 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7035  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  64.47 
 
 		 384 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000165617 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5424  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  64.66 
 
 		 386 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4877  radical SAM domain-containing protein  64.66 
 
 		 386 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4719  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  64.37 
 
 		 386 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5307  radical SAM family protein  64.08 
 
 		 386 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5553  radical SAM domain-containing protein  64.08 
 
 		 386 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4131  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  64.93 
 
 		 381 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2267  Fe-S oxidoreductase  64.37 
 
 		 389 aa  484  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1725  radical SAM family protein  63.22 
 
 		 383 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0670141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2971  hypothetical protein  63.79 
 
 		 382 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0553904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1287  radical SAM domain-containing protein  65.57 
 
 		 371 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2680  radical SAM family protein  63.51 
 
 		 389 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150776  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2244  radical SAM domain-containing protein  64.97 
 
 		 371 aa  474  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3245  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  61.6 
 
 		 382 aa  471  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3571  radical SAM family protein  62.07 
 
 		 386 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1831  radical SAM domain-containing protein  61.13 
 
 		 383 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3158  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  61.3 
 
 		 382 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3460  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  61.43 
 
 		 387 aa  461  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3768  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  61.43 
 
 		 387 aa  461  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4256  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  62.64 
 
 		 386 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.59824  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1288  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  60.52 
 
 		 392 aa  460  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3658  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  61.43 
 
 		 387 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0969  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  60.29 
 
 		 387 aa  455  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6342  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  60.57 
 
 		 384 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7158  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  60 
 
 		 384 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1728  radical SAM family protein  62.07 
 
 		 388 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.791785  normal  0.0366359 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2079  MoaA/NifB/PqqE family Fe-S oxidoreductase  56.89 
 
 		 336 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3361  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  57.06 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.941975  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3249  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  59.08 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.792504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2847  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  59.08 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1015  radical SAM family Fe-S protein  57.28 
 
 		 366 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0391907  normal  0.466336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4083  radical SAM domain-containing protein  61.18 
 
 		 336 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3457  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  58.95 
 
 		 339 aa  401  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0826  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  56.79 
 
 		 337 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.256838 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0220  radical SAM family protein  57.94 
 
 		 340 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1219  radical SAM family protein  57.41 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6662  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  52.32 
 
 		 334 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.549457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1699  radical SAM domain-containing protein  52.24 
 
 		 334 aa  366  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.440195  hitchhiker  0.000169379 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2595  radical SAM family protein  50.77 
 
 		 332 aa  347  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.90136  normal  0.0805169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6192  radical SAM domain-containing protein  49.69 
 
 		 332 aa  344  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0225613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0827  radical SAM family protein  48.92 
 
 		 334 aa  341  1e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.731351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5711  radical SAM domain-containing protein  47.04 
 
 		 335 aa  331  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23060  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  47.18 
 
 		 334 aa  326  4.0000000000000003e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.1711 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2446  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  46.58 
 
 		 336 aa  305  7e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1192  radical SAM domain-containing protein  42.63 
 
 		 332 aa  301  8.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2823  radical SAM family protein  42.32 
 
 		 332 aa  296  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0411588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0685  radical SAM domain-containing protein  42.01 
 
 		 332 aa  295  8e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1017  radical SAM domain-containing protein  42.01 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0882  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  42.32 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000626988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3363  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  42.01 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2236  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  40.36 
 
 		 333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0865  radical SAM domain-containing protein  41.64 
 
 		 331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3273  radical SAM domain-containing protein  51.41 
 
 		 157 aa  159  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347908  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  28.33 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  28.33 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  26.86 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  25 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  25.53 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  29.07 
 
 		 418 aa  72.8  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.16 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  29.59 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.16 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  24.84 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  28.07 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.9 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  27.39 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  31.95 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  29.94 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.5 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  30.06 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 465 aa  63.2  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  28.57 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  28.25 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  27.07 
 
 		 338 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  24.41 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  24.41 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>