More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1697 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
426 aa  868    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3223  putative carbohydrate kinase  52.73 
 
 
424 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2028  carbohydrate kinase FGGY  53.41 
 
 
432 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2020  carbohydrate kinase, FGGY  50.59 
 
 
476 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2006  carbohydrate kinase, FGGY  47.03 
 
 
413 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301028  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1579  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  45.84 
 
 
432 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0974  carbohydrate kinase, FGGY  45.54 
 
 
433 aa  368  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0442586  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5151  carbohydrate kinase FGGY  46.35 
 
 
431 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.68115e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0870  carbohydrate kinase FGGY  45.01 
 
 
423 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.781691  decreased coverage  0.000000974771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2154  carbohydrate kinase FGGY  44.83 
 
 
427 aa  361  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126362  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2564  carbohydrate kinase, FGGY  45.26 
 
 
423 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0926  carbohydrate kinase, FGGY  47.1 
 
 
424 aa  356  5e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4096  carbohydrate kinase  44.34 
 
 
416 aa  349  5e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1241  carbohydrate kinase, FGGY  42.29 
 
 
435 aa  341  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000316835  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2638  carbohydrate kinase FGGY  43.03 
 
 
417 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3465  carbohydrate kinase FGGY  43.09 
 
 
417 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1396  carbohydrate kinase, FGGY  43.5 
 
 
425 aa  325  7e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0326227 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2187  carbohydrate kinase FGGY  42.76 
 
 
424 aa  316  5e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1226  FGGY family sugar kinase  45.05 
 
 
422 aa  309  6.999999999999999e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.806578  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2462  sugar kinase  41.78 
 
 
426 aa  305  8.000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.277689  hitchhiker  0.00000000000164105 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22191  carbohydrate kinase, FGGY family protein  41.86 
 
 
427 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0465  carbohydrate kinase  38.64 
 
 
412 aa  250  4e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1870  carbohydrate kinase FGGY family  38.68 
 
 
418 aa  239  6.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03341  carbohydrate kinase  32.78 
 
 
409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.913546  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03351  carbohydrate kinase  33.88 
 
 
409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.406346  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33450  predicted protein  35.58 
 
 
500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03991  carbohydrate kinase  34.88 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.14778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13290  pentulose/hexulose kinase  37.06 
 
 
496 aa  233  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03441  carbohydrate kinase  36.56 
 
 
414 aa  233  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.612767  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0316  carbohydrate kinase  32.78 
 
 
409 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  34.19 
 
 
484 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1686  sugar kinase  34.66 
 
 
411 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2493  carbohydrate kinase FGGY  36.32 
 
 
474 aa  226  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38341  predicted protein  35.81 
 
 
442 aa  226  7e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300966  normal  0.435151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4080  carbohydrate kinase FGGY  33.26 
 
 
536 aa  203  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128065  normal  0.790365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8238  carbohydrate kinase, FGGY  35.07 
 
 
492 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.758383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3132  carbohydrate kinase FGGY  33.09 
 
 
485 aa  202  9e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  28.38 
 
 
494 aa  142  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  27 
 
 
511 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  26.98 
 
 
517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  26.98 
 
 
517 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  30.05 
 
 
502 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  29.72 
 
 
496 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  25.11 
 
 
530 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  27.27 
 
 
496 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  25.95 
 
 
500 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  29.05 
 
 
512 aa  120  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  25.45 
 
 
518 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  27.4 
 
 
493 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  26.88 
 
 
487 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  27.63 
 
 
491 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  23.65 
 
 
496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  24.15 
 
 
492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  24.15 
 
 
492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  23.64 
 
 
506 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  27.42 
 
 
484 aa  114  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  27.19 
 
 
492 aa  113  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  27.17 
 
 
493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  26.71 
 
 
493 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  24.89 
 
 
489 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  24.89 
 
 
499 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  26.09 
 
 
508 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  26.09 
 
 
482 aa  110  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  24.02 
 
 
509 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  25.32 
 
 
519 aa  110  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  27.77 
 
 
483 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  26.94 
 
 
493 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  26.07 
 
 
496 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  24.94 
 
 
500 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  26.35 
 
 
496 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  26.02 
 
 
488 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  26.94 
 
 
493 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  22.79 
 
 
511 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  27.57 
 
 
502 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  26.94 
 
 
493 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  27.93 
 
 
483 aa  107  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  25.84 
 
 
506 aa  107  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  25.94 
 
 
472 aa  106  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  25.38 
 
 
499 aa  107  6e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  27.54 
 
 
493 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  27.54 
 
 
493 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  27.53 
 
 
497 aa  106  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  22.57 
 
 
511 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  26.58 
 
 
524 aa  106  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  26.54 
 
 
515 aa  106  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  27.99 
 
 
493 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3685  carbohydrate kinase, FGGY  24.43 
 
 
510 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  23.53 
 
 
511 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  24.23 
 
 
509 aa  104  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  22.35 
 
 
511 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  26.16 
 
 
509 aa  104  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  25.27 
 
 
526 aa  104  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  22.9 
 
 
501 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  22.75 
 
 
489 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  26.11 
 
 
497 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  26.98 
 
 
508 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  26.08 
 
 
495 aa  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  22.82 
 
 
514 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  26.26 
 
 
493 aa  103  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  28.05 
 
 
487 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>