More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1660 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  100 
 
 		 206 aa  418  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  56.65 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  55.94 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  56.5 
 
 		 210 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  56 
 
 		 210 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  55.17 
 
 		 207 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  55.17 
 
 		 210 aa  211  9e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  54.68 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  49.26 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  54.68 
 
 		 210 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  53.69 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  52.71 
 
 		 210 aa  204  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  51.01 
 
 		 214 aa  202  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  51.78 
 
 		 217 aa  202  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  53 
 
 		 211 aa  201  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  50.77 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  48.74 
 
 		 223 aa  194  6e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  48.24 
 
 		 223 aa  192  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  50.26 
 
 		 204 aa  187  9e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  47.18 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  47.98 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  48.99 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  51.53 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  47.64 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  49.25 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  45.23 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  46.19 
 
 		 203 aa  175  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  45.77 
 
 		 206 aa  175  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  45.27 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  43.14 
 
 		 212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  43.14 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  48.51 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  45.23 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  43.78 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  46.08 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  43.78 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  43.78 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  43.78 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  43.78 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 206 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 206 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  43.78 
 
 		 206 aa  167  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  47.47 
 
 		 211 aa  168  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  43.78 
 
 		 206 aa  167  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  47 
 
 		 215 aa  167  8e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  44.44 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  44.22 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  44.72 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  42.36 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  43.78 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  42.49 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  41.79 
 
 		 703 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  40.62 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  45.08 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  49.02 
 
 		 221 aa  157  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  43.81 
 
 		 686 aa  157  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  44.12 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  42.35 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  42.05 
 
 		 705 aa  154  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  41.67 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  40.7 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  40.3 
 
 		 199 aa  152  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1314  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000054513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1986  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000464686  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1299  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160764  hitchhiker  0.0000000000000573213 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2169  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000154462 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1276  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.823229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  43.37 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1613  thymidylate kinase  42.23 
 
 		 213 aa  151  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000848369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2117  thymidylate kinase  42.57 
 
 		 209 aa  151  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  42.44 
 
 		 217 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2459  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0022435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1892  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243598  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  42.21 
 
 		 688 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2572  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232881  normal  0.0771597 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  42.44 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02330  thymidylate kinase  40.49 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1602  thymidylate kinase  43.48 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2452  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0414256  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01094  thymidylate kinase  41.26 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00390554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2549  dTMP kinase  41.26 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000242114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1219  thymidylate kinase  41.26 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000291901  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2226  thymidylate kinase  41.26 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000221684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2503  thymidylate kinase  41.26 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  unclonable  0.0000000113108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01102  hypothetical protein  41.26 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1220  thymidylate kinase  41.26 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000082141  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2029  thymidylate kinase  41.26 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000357383  hitchhiker  0.00000127305 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1661  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.159329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1736  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.603767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  41.12 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1477  thymidylate kinase  41.26 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000124035  hitchhiker  0.000000000959374 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  41.87 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>