More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1636 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  100 
 
 
447 aa  891    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  44.02 
 
 
452 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  44.72 
 
 
439 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3053  putative ribonuclease BN  43.78 
 
 
451 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2157  ribonuclease BN, putative  42.46 
 
 
430 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  36.43 
 
 
459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  35.1 
 
 
453 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  45.63 
 
 
472 aa  268  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  39.41 
 
 
422 aa  265  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  33.82 
 
 
417 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  33.5 
 
 
449 aa  244  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  35 
 
 
479 aa  237  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  34.26 
 
 
397 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  34.85 
 
 
446 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  34.09 
 
 
446 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  32.33 
 
 
450 aa  196  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3064  ribonuclease BN, putative  32.69 
 
 
473 aa  196  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00183316  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  30.95 
 
 
442 aa  186  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  33.15 
 
 
425 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  32.98 
 
 
499 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  32.1 
 
 
411 aa  179  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4086  putative ribonuclease BN  30.44 
 
 
487 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  29.74 
 
 
424 aa  169  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  30.31 
 
 
434 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0595  ribonuclease BN  27.95 
 
 
460 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2681  ribonuclease BN  28.37 
 
 
561 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.267088 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  30.17 
 
 
439 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  30.58 
 
 
436 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  34.67 
 
 
337 aa  144  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  34.67 
 
 
337 aa  143  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  34.74 
 
 
340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  34.31 
 
 
337 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  33.82 
 
 
295 aa  141  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  30.21 
 
 
437 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  34.44 
 
 
313 aa  141  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  33.09 
 
 
285 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  33.46 
 
 
323 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  33.46 
 
 
323 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  33.46 
 
 
323 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  33.46 
 
 
323 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  32.96 
 
 
320 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  34.39 
 
 
298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  24.04 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  28.21 
 
 
447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  33.47 
 
 
336 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  33.87 
 
 
451 aa  133  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  27.15 
 
 
538 aa  133  7.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  31.4 
 
 
439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  34.71 
 
 
429 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  31.77 
 
 
297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  34.26 
 
 
303 aa  131  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  34.39 
 
 
439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  28.36 
 
 
405 aa  127  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2958  ribonuclease BN  34.33 
 
 
286 aa  127  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  30.37 
 
 
310 aa  127  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  30 
 
 
443 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  30 
 
 
443 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  29.14 
 
 
443 aa  126  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  26.73 
 
 
403 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  30.83 
 
 
437 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  25.2 
 
 
525 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  30.83 
 
 
437 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  30.83 
 
 
437 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  26.01 
 
 
525 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  30.83 
 
 
437 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  30.83 
 
 
437 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  31.03 
 
 
441 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  34.07 
 
 
294 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  34.15 
 
 
442 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  34.15 
 
 
442 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  34.15 
 
 
442 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  32.81 
 
 
444 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  33.6 
 
 
314 aa  124  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  28.94 
 
 
443 aa  123  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  30.83 
 
 
437 aa  123  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  27.32 
 
 
422 aa  123  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  30.83 
 
 
436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  29.78 
 
 
442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  30.23 
 
 
443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  32.93 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  30.58 
 
 
294 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0935  ribonuclease BN  29.79 
 
 
432 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  32.93 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  32.93 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  32.93 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  30.83 
 
 
436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  32.93 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0452  ribonuclease BN, putative  31.64 
 
 
426 aa  121  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  30.97 
 
 
290 aa  119  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  30.97 
 
 
290 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  30.97 
 
 
290 aa  119  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  30.97 
 
 
290 aa  119  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  30.97 
 
 
290 aa  119  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  30.97 
 
 
290 aa  119  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  30.97 
 
 
290 aa  119  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  30.97 
 
 
290 aa  119  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  30.97 
 
 
290 aa  119  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  30.12 
 
 
412 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  32.08 
 
 
290 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  29.59 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>