More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1627 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  67.69 
 
 		 464 aa  658    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  67.47 
 
 		 463 aa  657    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  100 
 
 		 468 aa  969    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  68.26 
 
 		 464 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  70.11 
 
 		 471 aa  676    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  68.48 
 
 		 464 aa  661    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  71.52 
 
 		 469 aa  704    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  65.08 
 
 		 463 aa  621  1e-177  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0240  fumarate hydratase  66.81 
 
 		 466 aa  618  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  62.42 
 
 		 459 aa  615  1e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  62.42 
 
 		 459 aa  613  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2129  fumarate hydratase  66.16 
 
 		 487 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000218779  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  64.41 
 
 		 464 aa  607  9.999999999999999e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  64.35 
 
 		 466 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2881  fumarate hydratase  61.79 
 
 		 468 aa  588  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2970  fumarate hydratase  57.73 
 
 		 468 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1166  fumarate hydratase, class II  60.65 
 
 		 482 aa  580  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  61.09 
 
 		 463 aa  575  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1071  fumarate hydratase  60.39 
 
 		 465 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  58.58 
 
 		 467 aa  567  1e-160  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  58.48 
 
 		 462 aa  567  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  58.58 
 
 		 467 aa  567  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1627  fumarate hydratase class II  61.22 
 
 		 463 aa  561  1.0000000000000001e-159  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1545  fumarate hydratase  58.55 
 
 		 485 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  60.43 
 
 		 544 aa  559  1e-158  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  59.17 
 
 		 464 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  59.39 
 
 		 464 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 465 aa  557  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  58.52 
 
 		 465 aa  556  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  61.09 
 
 		 467 aa  554  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  57.55 
 
 		 464 aa  550  1e-155  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  59.78 
 
 		 492 aa  549  1e-155  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  61 
 
 		 464 aa  550  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7115  fumarate hydratase, class II  60.18 
 
 		 487 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  58.08 
 
 		 461 aa  550  1e-155  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  59.61 
 
 		 464 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  58.86 
 
 		 461 aa  547  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  59.35 
 
 		 510 aa  545  1e-154  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  58.91 
 
 		 462 aa  548  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  59.57 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 461 aa  546  1e-154  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1724  fumarate hydratase  55.34 
 
 		 513 aa  548  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  decreased coverage  0.00664146 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  57.17 
 
 		 463 aa  545  1e-154  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1449  fumarate hydratase  55.34 
 
 		 513 aa  547  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352432 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  56.33 
 
 		 463 aa  543  1e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2694  fumarate hydratase, class II  57.67 
 
 		 466 aa  541  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.650126  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0285  fumarate hydratase  56.11 
 
 		 463 aa  541  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0425  fumarate hydratase  57.68 
 
 		 498 aa  543  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  58.1 
 
 		 482 aa  542  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1618  fumarate hydratase  56.33 
 
 		 485 aa  541  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  56.55 
 
 		 463 aa  544  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  58.08 
 
 		 466 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  57.55 
 
 		 461 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  57.55 
 
 		 461 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  57.27 
 
 		 464 aa  538  9.999999999999999e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  58.01 
 
 		 465 aa  541  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  58.73 
 
 		 463 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  57.64 
 
 		 462 aa  535  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  57.64 
 
 		 462 aa  535  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  58.58 
 
 		 469 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 462 aa  535  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  58.95 
 
 		 472 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  57.42 
 
 		 462 aa  535  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  57.61 
 
 		 465 aa  537  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1636  fumarate hydratase  57.42 
 
 		 462 aa  534  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545327  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4865  fumarate hydratase  58.9 
 
 		 485 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.649966 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  57.64 
 
 		 462 aa  533  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  58.08 
 
 		 463 aa  533  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  58.02 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 462 aa  532  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  58.15 
 
 		 469 aa  531  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  58.21 
 
 		 463 aa  532  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  57.8 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  57.75 
 
 		 469 aa  533  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  57.86 
 
 		 472 aa  531  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  57.86 
 
 		 478 aa  533  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 462 aa  532  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  57.73 
 
 		 469 aa  534  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  58.46 
 
 		 464 aa  532  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  59.17 
 
 		 475 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  57.42 
 
 		 462 aa  531  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  57.42 
 
 		 462 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  57.42 
 
 		 462 aa  532  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  58.08 
 
 		 463 aa  534  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  57.86 
 
 		 472 aa  532  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_002620  TC0244  fumarate hydratase  56.51 
 
 		 463 aa  529  1e-149  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  58.63 
 
 		 464 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  58.63 
 
 		 464 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  58.63 
 
 		 631 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2816  fumarate hydratase, class II  57.02 
 
 		 467 aa  529  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  58.63 
 
 		 464 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  58.63 
 
 		 464 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  56.48 
 
 		 470 aa  531  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  58.63 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  57.64 
 
 		 463 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  57.24 
 
 		 471 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2046  fumarase  60.26 
 
 		 464 aa  528  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  57.36 
 
 		 464 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  56.28 
 
 		 464 aa  531  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  58.63 
 
 		 464 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>