More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1529 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  100 
 
 
467 aa  955    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  49.61 
 
 
500 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  39.95 
 
 
581 aa  322  7e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  43.03 
 
 
422 aa  316  5e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  39.63 
 
 
540 aa  307  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00319  putative cation efflux system protein  37.38 
 
 
672 aa  296  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  39.04 
 
 
546 aa  296  8e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  38.96 
 
 
491 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  38.21 
 
 
629 aa  294  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  36.47 
 
 
455 aa  292  7e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  39.33 
 
 
537 aa  289  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  36.32 
 
 
538 aa  289  8e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  37.47 
 
 
504 aa  288  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.24 
 
 
512 aa  286  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0715  putative cation efflux system protein  37.69 
 
 
489 aa  286  5.999999999999999e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2393  RND family efflux transporter MFP subunit  38.13 
 
 
525 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.28 
 
 
537 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  36.14 
 
 
529 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  38.23 
 
 
502 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.24 
 
 
568 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2457  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.13 
 
 
457 aa  277  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  35.64 
 
 
537 aa  277  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  42.44 
 
 
715 aa  277  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  38.9 
 
 
517 aa  276  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001396  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  32.75 
 
 
571 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  34.88 
 
 
509 aa  272  7e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2362  chemiosmotic efflux system B protein B  40.36 
 
 
377 aa  272  9e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06365  hypothetical protein  34.46 
 
 
577 aa  271  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  36.24 
 
 
472 aa  266  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.41 
 
 
456 aa  266  7e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  38.46 
 
 
683 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  35.94 
 
 
468 aa  265  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4405  secretion protein HlyD  37.63 
 
 
550 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.55 
 
 
465 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40 
 
 
460 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  35.29 
 
 
466 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.4 
 
 
438 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.538499  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  35.71 
 
 
473 aa  259  8e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1948  heavy metal efflux transporter, MFP subunit, putative  34.66 
 
 
439 aa  258  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1618  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.66 
 
 
439 aa  258  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.215683  hitchhiker  0.000019246 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2061  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.66 
 
 
482 aa  256  9e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.66 
 
 
482 aa  256  9e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.53 
 
 
494 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0277  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.01 
 
 
627 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.56 
 
 
486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1369  RND family efflux transporter MFP subunit  34.61 
 
 
488 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271399  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4832  RND family efflux transporter MFP subunit  37.01 
 
 
472 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.29 
 
 
509 aa  249  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.430144 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0060  secretion protein HlyD precursor  35.64 
 
 
477 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4658  secretion protein HlyD  36.56 
 
 
478 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.68 
 
 
508 aa  247  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3427  cation efflux system protein cusB precursor  34.95 
 
 
474 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  38.18 
 
 
455 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2740  secretion protein HlyD  35.54 
 
 
462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135625  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3642  putative cation efflux system protein cusB precursor  35.52 
 
 
475 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499465  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3812  RND family efflux transporter MFP subunit  35.53 
 
 
498 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.999648  normal  0.340628 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  37.44 
 
 
504 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4592  RND family efflux transporter MFP subunit  37.07 
 
 
477 aa  240  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246658  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  34.9 
 
 
473 aa  240  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  36.68 
 
 
451 aa  239  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484161  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1536  secretion protein HlyD  40.83 
 
 
625 aa  238  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  32.13 
 
 
500 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0150  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 
509 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0999403  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4358  secretion protein HlyD  33.08 
 
 
472 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4597  heavy metal efflux system protein, putative  32.56 
 
 
472 aa  234  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.6 
 
 
526 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  32.09 
 
 
502 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1604  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.42 
 
 
464 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.344035  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3782  RND family efflux transporter MFP subunit  31.62 
 
 
502 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  37.4 
 
 
527 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0283  RND family efflux transporter MFP subunit  33.16 
 
 
512 aa  231  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1853  secretion protein HlyD  34.14 
 
 
471 aa  231  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  38.1 
 
 
451 aa  230  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0154  heavy metal efflux protein, putative  30.6 
 
 
513 aa  230  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.235604  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4303  RND family efflux transporter MFP subunit  30.35 
 
 
514 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.35 
 
 
513 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6135  proton antiporter metal efflux protein SilB  33.18 
 
 
521 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418414  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.28 
 
 
432 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0163  RND family efflux transporter MFP subunit  31.18 
 
 
513 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4172  RND family efflux transporter MFP subunit  30.35 
 
 
513 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1102  secretion protein HlyD  36.22 
 
 
470 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  33.68 
 
 
526 aa  228  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0211  membrane-fusion protein-like protein  32.53 
 
 
650 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2394  secretion protein HlyD  33 
 
 
410 aa  224  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.372512  normal  0.032408 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3535  RND family efflux transporter MFP subunit  31.78 
 
 
529 aa  223  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3492  secretion protein HlyD  34.92 
 
 
545 aa  223  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4512  RND family efflux transporter MFP subunit  35.6 
 
 
552 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201635  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9868  Membrane-fusion protein  35.22 
 
 
475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2395  secretion protein HlyD  33.74 
 
 
417 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  hitchhiker  0.00226856 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0354  RND family efflux transporter MFP subunit  36.29 
 
 
518 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0190  RND family efflux transporter MFP subunit  31.91 
 
 
599 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.62 
 
 
497 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1260  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.93 
 
 
497 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3508  secretion protein HlyD  32.31 
 
 
460 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1156  RND family efflux transporter MFP subunit  35.59 
 
 
401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.820375  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2440  secretion protein HlyD  33.49 
 
 
408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.77 
 
 
497 aa  213  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.92 
 
 
500 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  35.63 
 
 
490 aa  208  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1626  putative cation efflux system transmembrane protein  33.09 
 
 
542 aa  207  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.182447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>