More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1497 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  100 
 
 
753 aa  1533    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  40.24 
 
 
797 aa  504  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  33.42 
 
 
779 aa  411  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  33.15 
 
 
730 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  33.96 
 
 
737 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  33.43 
 
 
727 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  32.28 
 
 
772 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  29.95 
 
 
745 aa  362  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  29.68 
 
 
743 aa  339  9e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  30.22 
 
 
756 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  39.43 
 
 
472 aa  325  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  29.45 
 
 
721 aa  317  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  29.4 
 
 
756 aa  317  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.22 
 
 
467 aa  308  3e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 
737 aa  304  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  37.76 
 
 
466 aa  303  1e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  28.92 
 
 
755 aa  300  8e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  27.25 
 
 
770 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  28.39 
 
 
733 aa  285  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  27.76 
 
 
731 aa  281  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  27.05 
 
 
726 aa  275  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  27.56 
 
 
711 aa  271  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 
738 aa  262  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  28.23 
 
 
774 aa  260  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.65 
 
 
804 aa  251  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  27.97 
 
 
736 aa  246  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  28.45 
 
 
734 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  28.25 
 
 
756 aa  244  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  28.93 
 
 
790 aa  241  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  38.66 
 
 
464 aa  240  6.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.81 
 
 
739 aa  235  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  26.65 
 
 
741 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.34 
 
 
738 aa  228  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.26 
 
 
745 aa  224  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  27.07 
 
 
722 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  27.89 
 
 
766 aa  220  6e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  25.58 
 
 
734 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  27.64 
 
 
872 aa  219  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  26.56 
 
 
758 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  25.73 
 
 
758 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  26.03 
 
 
790 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  24.65 
 
 
750 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  26.57 
 
 
778 aa  213  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.24 
 
 
720 aa  213  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.51 
 
 
739 aa  213  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  26.46 
 
 
753 aa  204  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  27.26 
 
 
803 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  28.37 
 
 
806 aa  198  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  27.85 
 
 
763 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  39.4 
 
 
454 aa  190  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  29.31 
 
 
527 aa  189  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  27.46 
 
 
803 aa  190  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.9 
 
 
720 aa  188  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  24.58 
 
 
710 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  25.74 
 
 
814 aa  185  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350341  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.14 
 
 
722 aa  184  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  24.57 
 
 
788 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  26.2 
 
 
795 aa  182  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  25.31 
 
 
772 aa  182  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  25.77 
 
 
776 aa  181  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  35.67 
 
 
492 aa  181  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.54 
 
 
575 aa  180  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  43.33 
 
 
232 aa  179  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 
764 aa  179  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 
750 aa  178  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  36.17 
 
 
505 aa  177  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  39.87 
 
 
463 aa  177  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  26.48 
 
 
739 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  26.76 
 
 
735 aa  176  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  24.69 
 
 
742 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  27.22 
 
 
746 aa  174  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  36.08 
 
 
503 aa  174  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  27.22 
 
 
746 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  26.5 
 
 
734 aa  174  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0587  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.03 
 
 
710 aa  173  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  24.24 
 
 
756 aa  173  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  26.69 
 
 
739 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  26.48 
 
 
739 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  36.63 
 
 
667 aa  173  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  36.42 
 
 
624 aa  173  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  27.32 
 
 
815 aa  172  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  26.14 
 
 
740 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  27.22 
 
 
746 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  26.48 
 
 
739 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  23.34 
 
 
782 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  27.48 
 
 
790 aa  171  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  25.23 
 
 
727 aa  171  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  25.19 
 
 
795 aa  171  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  22.95 
 
 
741 aa  171  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  39.91 
 
 
225 aa  170  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  34.44 
 
 
496 aa  170  9e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  26.53 
 
 
794 aa  170  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  25.61 
 
 
732 aa  170  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  40.28 
 
 
239 aa  169  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  22.32 
 
 
708 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 
778 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  35.16 
 
 
508 aa  167  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.05 
 
 
724 aa  167  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  24.9 
 
 
775 aa  167  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  36.88 
 
 
466 aa  167  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>