155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1464 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  100 
 
 		 150 aa  307  2.9999999999999997e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  48.1 
 
 		 175 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  51.88 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  43.05 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  44.83 
 
 		 185 aa  126  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  42.86 
 
 		 225 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  40.69 
 
 		 216 aa  122  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  47.01 
 
 		 238 aa  121  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  42 
 
 		 244 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  41.84 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  40.38 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  37.67 
 
 		 232 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  43.24 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  41.61 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  46.21 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  37.41 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  43.92 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  48.84 
 
 		 208 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  37.34 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  46.92 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  36.54 
 
 		 162 aa  103  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  41.67 
 
 		 193 aa  101  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  40.44 
 
 		 196 aa  101  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  43.61 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  38.17 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  38.97 
 
 		 171 aa  98.2  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  39.46 
 
 		 228 aa  96.3  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  35.95 
 
 		 185 aa  94.7  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  41.33 
 
 		 187 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  37.25 
 
 		 206 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  36.05 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  33.55 
 
 		 169 aa  91.3  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  37.06 
 
 		 227 aa  90.9  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  36.3 
 
 		 192 aa  90.9  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  38.55 
 
 		 179 aa  90.5  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  35.67 
 
 		 221 aa  90.1  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  31.13 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  36.31 
 
 		 183 aa  87.8  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  36.18 
 
 		 191 aa  87.8  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  36.6 
 
 		 221 aa  87  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  36.18 
 
 		 205 aa  87  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  33.11 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  35.15 
 
 		 180 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  37.33 
 
 		 194 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  35.94 
 
 		 184 aa  85.9  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  33.11 
 
 		 175 aa  84.7  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  35.37 
 
 		 185 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  30.61 
 
 		 175 aa  84  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  36.31 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  32 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  35.22 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  43.85 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  39.44 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  37.75 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  32.65 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  37.67 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  32.87 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  39.6 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  30.97 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  35.33 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  36.69 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  36.2 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  35.86 
 
 		 183 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  32.32 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  29.66 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  32.24 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  39.67 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  30.53 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  33.56 
 
 		 212 aa  62  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  29.65 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  29.65 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  33.58 
 
 		 388 aa  60.8  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  32.48 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  34.04 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  34.04 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 333 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  30.56 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  31.88 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  32.43 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  30.41 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  26.97 
 
 		 205 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  31.45 
 
 		 241 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  31.3 
 
 		 214 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  34.07 
 
 		 214 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  29.89 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  26.9 
 
 		 189 aa  52.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  27.66 
 
 		 197 aa  51.6  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43237  predicted protein  27.34 
 
 		 918 aa  51.2  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.31647 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43350  predicted protein  27.34 
 
 		 918 aa  51.2  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  31.54 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  29.46 
 
 		 214 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  29.46 
 
 		 214 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  33.61 
 
 		 241 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  29.37 
 
 		 228 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  29.37 
 
 		 228 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  28.03 
 
 		 211 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  30.71 
 
 		 256 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  29.8 
 
 		 301 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  35 
 
 		 243 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  31.76 
 
 		 242 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>