More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1434 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1434  transketolase  100 
 
 
326 aa  657    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  77.47 
 
 
326 aa  513  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1516  hypothetical protein  71.6 
 
 
324 aa  493  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1467  hypothetical protein  71.3 
 
 
324 aa  493  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0650  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  70.86 
 
 
326 aa  491  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0753  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  70.55 
 
 
326 aa  490  1e-137  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.102585  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3377  Transketolase central region  70.86 
 
 
326 aa  484  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4977  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  71.3 
 
 
325 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  72.31 
 
 
326 aa  482  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4133  putative puryvate dehydrogenase E1 component subunit beta  70.86 
 
 
326 aa  482  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6076  transketolase central region  71.3 
 
 
326 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507877  normal  0.0309873 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0238  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  71.78 
 
 
326 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.26153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3246  transketolase, central region  69.14 
 
 
334 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3747  Transketolase central region  70.83 
 
 
355 aa  460  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1798  putative pyruvate decarboxylase E1 (Beta subunit) oxidoreductase protein  71.78 
 
 
326 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.044195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10780  TPP-dependent dehydrogenase, E1 component beta subunit  68.21 
 
 
328 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789214  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1710  putative pyruvate dehydrogenase E1 component, beta chain  67.49 
 
 
333 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19910  putative pyruvate dehydrogenase E1 component, beta chain  66.87 
 
 
333 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.045452  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001584  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component beta subunit  63.27 
 
 
327 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05554  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit  63.27 
 
 
327 aa  433  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  57.76 
 
 
342 aa  386  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  58.2 
 
 
346 aa  381  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  58.15 
 
 
320 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  56.52 
 
 
336 aa  375  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0675  Transketolase central region  58.2 
 
 
327 aa  374  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.045738  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  56.92 
 
 
320 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2647  transketolase, central region  55.52 
 
 
326 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2655  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  58.77 
 
 
320 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2899  transketolase, central region  56.92 
 
 
320 aa  359  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  54.77 
 
 
320 aa  359  4e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  51.69 
 
 
325 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  50.77 
 
 
325 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  51.38 
 
 
325 aa  350  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  54.66 
 
 
328 aa  350  2e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  53.68 
 
 
326 aa  349  4e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  52.62 
 
 
324 aa  346  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  52.62 
 
 
324 aa  346  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  52.62 
 
 
324 aa  346  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  51.39 
 
 
327 aa  346  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  54.94 
 
 
325 aa  346  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  54.86 
 
 
332 aa  345  7e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  50.46 
 
 
325 aa  343  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  51.25 
 
 
320 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  49.85 
 
 
325 aa  343  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  49.85 
 
 
325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  49.85 
 
 
325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  49.85 
 
 
325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  49.85 
 
 
325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  49.85 
 
 
325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  49.85 
 
 
325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  49.85 
 
 
325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  49.85 
 
 
325 aa  342  4e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  53.58 
 
 
335 aa  342  7e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  49.54 
 
 
325 aa  341  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  48.92 
 
 
325 aa  339  4e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  51.69 
 
 
324 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  47.08 
 
 
325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  47.08 
 
 
325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  49.69 
 
 
326 aa  336  3.9999999999999995e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2192  Transketolase central region  52.96 
 
 
323 aa  331  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2793  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  53.14 
 
 
702 aa  329  4e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  49.54 
 
 
327 aa  323  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0329  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  49.69 
 
 
326 aa  318  6e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2321  Transketolase central region  51.38 
 
 
324 aa  318  1e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1562  transketolase, central region  52.01 
 
 
334 aa  317  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.386983  normal  0.558748 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2852  Transketolase central region  50.93 
 
 
331 aa  316  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2777  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  49.12 
 
 
337 aa  315  7e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.222973  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3242  Transketolase central region  49.54 
 
 
339 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0939038  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  47.65 
 
 
337 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  47.65 
 
 
337 aa  311  6.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4398  Transketolase central region  51.29 
 
 
325 aa  311  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3552  transketolase central region  47.65 
 
 
337 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  48.48 
 
 
328 aa  310  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  47.4 
 
 
327 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  49.24 
 
 
327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0108  transketolase central region  49.54 
 
 
329 aa  309  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741994  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  47.09 
 
 
327 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1135  Transketolase central region  48.92 
 
 
324 aa  308  9e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.323286  normal  0.423895 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0181  putative branched-chain alpha keto acid dehydrogenase E1 beta subunit  51.84 
 
 
327 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7268  transketolase central region  49.7 
 
 
388 aa  306  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.801653  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2467  Transketolase central region  49.85 
 
 
342 aa  306  3e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.773321  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.29 
 
 
341 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0057  transketolase  49.55 
 
 
353 aa  305  6e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl040  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  45.87 
 
 
329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2037  transketolase, central region  46.93 
 
 
325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0108  transketolase, central region  48.62 
 
 
329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3331  transketolase central region  50.77 
 
 
324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.438418 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1381  transketolase, central region  46.93 
 
 
325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0848887  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2827  transketolase central region  47.35 
 
 
337 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3222  Transketolase central region  50.31 
 
 
345 aa  302  5.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2027  transketolase, central region  47.24 
 
 
325 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0248675  hitchhiker  0.0000129585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1948  transketolase, central region  47.24 
 
 
325 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.858675  decreased coverage  0.000302013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2130  transketolase, central region  47.24 
 
 
325 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.88258  hitchhiker  0.000129918 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2340  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  47.24 
 
 
325 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01955  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit  46.01 
 
 
325 aa  301  7.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04530  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  48.74 
 
 
344 aa  302  7.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4857  Transketolase central region  49.69 
 
 
326 aa  301  7.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2245  transketolase central region  45.71 
 
 
325 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.38248  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0705  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.47 
 
 
337 aa  301  8.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346311  normal  0.842188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3381  Transketolase central region  50.3 
 
 
357 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410697  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>