More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1400 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
938 aa  1933    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
1002 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 
835 aa  359  1.9999999999999998e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 
1223 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  35.06 
 
 
1015 aa  339  9.999999999999999e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.19 
 
 
1759 aa  333  9e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.18 
 
 
866 aa  328  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.12 
 
 
930 aa  327  5e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 
657 aa  327  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.81 
 
 
1287 aa  324  6e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 
1406 aa  320  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  42.86 
 
 
547 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 
845 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  34.67 
 
 
659 aa  314  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 
1261 aa  312  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 
869 aa  311  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.67 
 
 
1152 aa  310  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  44.53 
 
 
518 aa  310  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.86 
 
 
1218 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
683 aa  306  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 
816 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 
657 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 
539 aa  300  8e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.75 
 
 
641 aa  299  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 
776 aa  297  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
659 aa  297  7e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
1501 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 
1185 aa  295  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 
761 aa  293  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 
776 aa  293  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 
761 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  43.93 
 
 
551 aa  290  8e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 
1084 aa  287  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  39.41 
 
 
884 aa  286  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  36.68 
 
 
1303 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 
639 aa  285  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5975  histidine kinase  43.55 
 
 
524 aa  284  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.005421  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
1478 aa  283  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.55 
 
 
764 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
1297 aa  281  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 
526 aa  281  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 
776 aa  282  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 
529 aa  281  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 
1344 aa  280  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
1330 aa  279  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  39.95 
 
 
537 aa  278  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0756537 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.72 
 
 
760 aa  278  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
530 aa  278  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
689 aa  277  7e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 
530 aa  277  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 
844 aa  277  8e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  40.78 
 
 
755 aa  276  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.63 
 
 
1233 aa  274  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 
528 aa  273  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
844 aa  271  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.7 
 
 
1535 aa  270  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  41.6 
 
 
741 aa  270  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
528 aa  269  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.2 
 
 
730 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  42.2 
 
 
742 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.08 
 
 
752 aa  268  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  37.37 
 
 
1222 aa  267  5.999999999999999e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.41 
 
 
1088 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.53 
 
 
623 aa  266  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 
664 aa  265  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2942  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.6 
 
 
702 aa  265  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3028  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.8 
 
 
702 aa  264  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.337956  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.56 
 
 
738 aa  263  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.57 
 
 
2468 aa  263  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0027  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 
917 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 
1331 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5630  histidine kinase  41.89 
 
 
714 aa  262  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.11737 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 
1068 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
680 aa  259  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 
865 aa  258  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.7 
 
 
1242 aa  257  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 
660 aa  257  9e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3122  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 
540 aa  255  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.340394  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3134  histidine kinase  40.3 
 
 
702 aa  255  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22778  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.85 
 
 
522 aa  255  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5775  histidine kinase  38.96 
 
 
554 aa  255  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.941039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.83 
 
 
1453 aa  255  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  38.44 
 
 
554 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4167  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 
592 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.85 
 
 
1348 aa  253  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 
906 aa  252  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 
633 aa  250  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2013  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 
569 aa  249  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00655857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
922 aa  249  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 
1279 aa  248  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.11 
 
 
1391 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 
708 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
568 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 
745 aa  246  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 
755 aa  244  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.05 
 
 
1698 aa  243  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3427  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  28.72 
 
 
2031 aa  243  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0889636 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.91 
 
 
1361 aa  239  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1737  histidine kinase  39.78 
 
 
633 aa  237  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1664  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.06 
 
 
633 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0956689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>