107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1391 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 251 aa  527  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11261  hypothetical protein  36.84 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0851453 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.2 
 
 		 259 aa  151  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12551  hypothetical protein  33.63 
 
 		 241 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45928  predicted protein  33.33 
 
 		 359 aa  102  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.4 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.69 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.73 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  26.56 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.15 
 
 		 282 aa  72  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.42 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.48 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  25.44 
 
 		 296 aa  68.6  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.14 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.2 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.71 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  23.75 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  20.78 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.89 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  23.33 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  23.24 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.55 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.97 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  24.89 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.05 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.23 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.23 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.14 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.61 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.75 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.56 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.71 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0319  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.82 
 
 		 328 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  19.92 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.1 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  23.74 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  22.22 
 
 		 296 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  26.57 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.74 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.1 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3838  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.85 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.7 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.26 
 
 		 300 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1483  hypothetical protein  26.09 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4667  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.22 
 
 		 413 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.180988  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.78 
 
 		 253 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  24.69 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.69 
 
 		 281 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  22.34 
 
 		 309 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.27 
 
 		 293 aa  52  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  23.44 
 
 		 258 aa  52  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.39 
 
 		 306 aa  52  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.58 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  22.81 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  21.63 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.69 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2023  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.76 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  27.98 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.03 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  23.42 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.37 
 
 		 292 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.37 
 
 		 292 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.03 
 
 		 268 aa  49.3  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  22.63 
 
 		 306 aa  49.3  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.74 
 
 		 274 aa  49.3  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.32 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1020  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.67 
 
 		 296 aa  48.5  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  22.08 
 
 		 302 aa  48.5  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.41 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  23.84 
 
 		 299 aa  47.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.72 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  23.37 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  23.37 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  23.37 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  23.27 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.57 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  22.33 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3596  hypothetical protein  23.33 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.33 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.69 
 
 		 303 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  21.93 
 
 		 276 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  21.25 
 
 		 306 aa  46.2  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.85 
 
 		 283 aa  45.4  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  26.32 
 
 		 298 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.84 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.09 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.14 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.48 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.7 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.7 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  19.92 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  24.27 
 
 		 298 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  23.03 
 
 		 308 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29154  predicted protein  23.31 
 
 		 305 aa  43.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.971691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>