More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1245 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  66.67 
 
 		 563 aa  734    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  64.62 
 
 		 558 aa  714    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  69.46 
 
 		 545 aa  777    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  100 
 
 		 535 aa  1066    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6885  cytochrome c oxidase, subunit I  65.9 
 
 		 558 aa  694    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  64.96 
 
 		 554 aa  737    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  66.67 
 
 		 563 aa  735    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  66.03 
 
 		 548 aa  744    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  66.67 
 
 		 563 aa  734    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4179  cytochrome c oxidase, subunit I  66.67 
 
 		 557 aa  721    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  68.18 
 
 		 544 aa  762    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0827  cytochrome c oxidase, subunit I  62.57 
 
 		 540 aa  696    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.541437  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  71.51 
 
 		 552 aa  786    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  65.9 
 
 		 565 aa  715    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5816  cytochrome c oxidase, subunit I  65.13 
 
 		 558 aa  685    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099341  hitchhiker  0.00453601 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  58.4 
 
 		 564 aa  620  1e-176  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0230  cytochrome c oxidase, subunit I  60.77 
 
 		 565 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123434  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0804  cytochrome-c oxidase  58.3 
 
 		 554 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0852  cytochrome c oxidase, subunit I  57.92 
 
 		 554 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0856  cytochrome c oxidase, subunit I  57.92 
 
 		 554 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0849  cytochrome c oxidase subunit I type  57.66 
 
 		 555 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  56.21 
 
 		 556 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  56.75 
 
 		 542 aa  594  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2705  Cytochrome-c oxidase  56.81 
 
 		 528 aa  559  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2274  cytochrome-c oxidase  55.6 
 
 		 554 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.413145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  51.76 
 
 		 541 aa  549  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  52.02 
 
 		 539 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  52.9 
 
 		 541 aa  543  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1677  cytochrome c oxidase, subunit I  55.03 
 
 		 555 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1601  cytochrome c oxidase, subunit I  55.03 
 
 		 555 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  52.35 
 
 		 541 aa  538  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2526  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit I  53.46 
 
 		 543 aa  536  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000123308  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  51.12 
 
 		 541 aa  531  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  50.48 
 
 		 539 aa  527  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1823  cytochrome-c oxidase  52.6 
 
 		 543 aa  519  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  50.75 
 
 		 542 aa  512  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  45.35 
 
 		 564 aa  466  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  47.24 
 
 		 546 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  47.24 
 
 		 546 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  44.96 
 
 		 541 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  44.77 
 
 		 541 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  44.77 
 
 		 541 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  45.05 
 
 		 615 aa  461  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  45.78 
 
 		 575 aa  461  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  45.26 
 
 		 560 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  45.61 
 
 		 552 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  45.76 
 
 		 556 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  46.23 
 
 		 555 aa  461  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  44.07 
 
 		 587 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  44.31 
 
 		 590 aa  460  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  44.19 
 
 		 539 aa  458  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  45.36 
 
 		 558 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  44.31 
 
 		 541 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  44.49 
 
 		 555 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  44.49 
 
 		 555 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  44.27 
 
 		 559 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  44.16 
 
 		 548 aa  446  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  43.85 
 
 		 553 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  44.18 
 
 		 566 aa  438  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  43.92 
 
 		 641 aa  433  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  44.51 
 
 		 641 aa  433  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  42.23 
 
 		 806 aa  430  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  42.64 
 
 		 554 aa  429  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  42.47 
 
 		 611 aa  425  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  42.5 
 
 		 620 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  42.69 
 
 		 620 aa  428  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  42.69 
 
 		 620 aa  428  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  42.69 
 
 		 620 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  41.45 
 
 		 553 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  42.69 
 
 		 620 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  42.86 
 
 		 638 aa  428  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  42.5 
 
 		 620 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  42.3 
 
 		 620 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  41.07 
 
 		 796 aa  427  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  42.69 
 
 		 620 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  42.47 
 
 		 611 aa  425  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  42.02 
 
 		 540 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1960  cytochrome c oxidase, subunit I  44.47 
 
 		 561 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00322963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  43.94 
 
 		 557 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  41.96 
 
 		 555 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  43.62 
 
 		 589 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  41.15 
 
 		 619 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0668  quinol oxidase subunit I  42.86 
 
 		 647 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0612  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  42.86 
 
 		 647 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0613  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  42.86 
 
 		 647 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.666796  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  42.16 
 
 		 536 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0736  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  42.86 
 
 		 644 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.283518  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5490  cytochrome c oxidase, subunit I  41.6 
 
 		 669 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0702  quinol oxidase subunit I  42.86 
 
 		 644 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0757  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  42.86 
 
 		 644 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00253783 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  41.26 
 
 		 555 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  41.94 
 
 		 532 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0829  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  42.86 
 
 		 644 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2184  cytochrome-c oxidase  42.38 
 
 		 679 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0453262 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0080  putative cytochrome c oxidase subunit I  41.8 
 
 		 680 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150485  hitchhiker  0.00336295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2957  Cytochrome-c oxidase  40.44 
 
 		 585 aa  416  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1404  cytochrome-c oxidase  44.19 
 
 		 556 aa  418  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.29775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4601  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  42.86 
 
 		 644 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  41.95 
 
 		 531 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  42.64 
 
 		 661 aa  415  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>