77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1241 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  48.21 
 
 		 218 aa  185  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  49.19 
 
 		 195 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  46.7 
 
 		 175 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  46.86 
 
 		 175 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  47.19 
 
 		 205 aa  161  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  40 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  45.71 
 
 		 175 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  44.13 
 
 		 172 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  42.86 
 
 		 173 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  43.26 
 
 		 194 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  42.29 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  41.21 
 
 		 175 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  61 
 
 		 175 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  42.94 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  41.57 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  38.12 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  40.11 
 
 		 190 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  40.11 
 
 		 190 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  34.59 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  39.56 
 
 		 190 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  38.15 
 
 		 190 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  36.18 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  33.52 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  33.33 
 
 		 499 aa  106  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  45.54 
 
 		 176 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  31.16 
 
 		 477 aa  93.2  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  26.6 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  32.71 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  36.89 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  28.49 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  28.05 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  36.26 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  33.67 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  30.91 
 
 		 151 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  33.71 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  37.93 
 
 		 645 aa  56.6  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  25.14 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  33.33 
 
 		 644 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  30.33 
 
 		 643 aa  52  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  28.87 
 
 		 393 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  32.79 
 
 		 637 aa  51.6  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2443  cytochrome c class I  30.88 
 
 		 143 aa  51.6  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  27.84 
 
 		 393 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  23.3 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  29.2 
 
 		 394 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0116  hypothetical protein  27.96 
 
 		 166 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  32.5 
 
 		 649 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  29.9 
 
 		 394 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  29.9 
 
 		 394 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  31.91 
 
 		 138 aa  48.5  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  32.99 
 
 		 254 aa  47.4  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  27.96 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  34.38 
 
 		 664 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  27.5 
 
 		 657 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  26.8 
 
 		 394 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  26.26 
 
 		 393 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  34.58 
 
 		 653 aa  46.6  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  28.97 
 
 		 546 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  27.55 
 
 		 702 aa  45.1  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  27.55 
 
 		 702 aa  45.1  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  29.57 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.35 
 
 		 653 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  25.66 
 
 		 154 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  31.46 
 
 		 640 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  32.63 
 
 		 652 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 647 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  29.35 
 
 		 647 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  32.1 
 
 		 636 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  27.84 
 
 		 388 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  23.21 
 
 		 395 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  28.41 
 
 		 379 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  27.84 
 
 		 388 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  31.46 
 
 		 642 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  31.46 
 
 		 642 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  30.34 
 
 		 640 aa  41.6  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>