More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1216 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03509  ATP-dependent DNA helicase  57.23 
 
 
693 aa  740    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0053  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.23 
 
 
693 aa  739    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4180  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.43 
 
 
693 aa  722    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.83 
 
 
692 aa  773    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0041  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.43 
 
 
693 aa  722    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0722  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.3 
 
 
684 aa  660    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000137671  hitchhiker  0.00000253506 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2025  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.1 
 
 
691 aa  664    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5025  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.46 
 
 
693 aa  740    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.98 
 
 
693 aa  751    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0037  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.58 
 
 
693 aa  724    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4976  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.31 
 
 
697 aa  741    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001866  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.88 
 
 
689 aa  741    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.74 
 
 
704 aa  754    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4364  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.89 
 
 
688 aa  723    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0065  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.36 
 
 
691 aa  757    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.97 
 
 
692 aa  775    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.74 
 
 
696 aa  732    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03461  hypothetical protein  57.23 
 
 
693 aa  740    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.71 
 
 
690 aa  664    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.85 
 
 
690 aa  668    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0201  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.36 
 
 
691 aa  758    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4024  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.31 
 
 
693 aa  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.42 
 
 
683 aa  655    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00158  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.18 
 
 
690 aa  743    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.85 
 
 
692 aa  773    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.02 
 
 
728 aa  646    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.38 
 
 
691 aa  770    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0568  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.3 
 
 
684 aa  660    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.457538  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4592  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.39 
 
 
691 aa  715    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000346665 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
712 aa  1436    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.77 
 
 
691 aa  766    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3863  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.23 
 
 
693 aa  738    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4103  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.31 
 
 
693 aa  739    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0087  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.85 
 
 
693 aa  723    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6122  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.91 
 
 
691 aa  762    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0059  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.23 
 
 
693 aa  738    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00625  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.17 
 
 
693 aa  744    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.79 
 
 
690 aa  704    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.45 
 
 
747 aa  672    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.6 
 
 
696 aa  729    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0884  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.73 
 
 
692 aa  669    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.39 
 
 
693 aa  752    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.83 
 
 
692 aa  791    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.12 
 
 
696 aa  733    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.46 
 
 
693 aa  741    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3507  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.28 
 
 
691 aa  716    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.31 
 
 
686 aa  796    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.49 
 
 
693 aa  774    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3717  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.32 
 
 
695 aa  716    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.58 
 
 
690 aa  778    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.14 
 
 
686 aa  691    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4070  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.31 
 
 
693 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.75743 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3476  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.47 
 
 
691 aa  732    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.59 
 
 
691 aa  741    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.33 
 
 
697 aa  808    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3987  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.02 
 
 
693 aa  737    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.46 
 
 
693 aa  740    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0647882 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2283  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.6 
 
 
692 aa  703    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.09 
 
 
693 aa  754    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4871  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.39 
 
 
693 aa  738    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708486  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4496  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.1 
 
 
693 aa  747    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.27 
 
 
693 aa  753    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.87 
 
 
691 aa  788    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4156  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.56 
 
 
693 aa  741    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.12 
 
 
691 aa  741    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.89 
 
 
691 aa  733    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.47 
 
 
693 aa  732    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.89 
 
 
696 aa  723    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3672  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.74 
 
 
696 aa  723    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0149204  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.74 
 
 
705 aa  761    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.4 
 
 
705 aa  732    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.89 
 
 
696 aa  734    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70570  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.91 
 
 
691 aa  769    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.23 
 
 
703 aa  683    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.85 
 
 
691 aa  770    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.18 
 
 
687 aa  659    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.38589  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.82 
 
 
696 aa  736    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.71 
 
 
684 aa  660    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.18 
 
 
696 aa  729    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.1 
 
 
691 aa  793    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.7 
 
 
717 aa  671    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3961  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.27 
 
 
693 aa  741    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.74 
 
 
704 aa  753    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.58 
 
 
691 aa  726    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.15 
 
 
715 aa  633  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1872  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.77 
 
 
718 aa  634  1e-180  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.81 
 
 
678 aa  630  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2545  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.15 
 
 
715 aa  631  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419698  normal  0.139865 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1798  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.62 
 
 
718 aa  629  1e-179  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.36 
 
 
737 aa  629  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3988  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.68 
 
 
768 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0697  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.09 
 
 
832 aa  624  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0614  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.09 
 
 
785 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2523  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.95 
 
 
740 aa  620  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174099  normal  0.914241 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0639  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.85 
 
 
792 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0124  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.36 
 
 
692 aa  619  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3812  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.73 
 
 
777 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3737  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.64 
 
 
665 aa  617  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0240  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.8 
 
 
771 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0724  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.8 
 
 
771 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>