More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1215 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  100 
 
 		 128 aa  258  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  71.43 
 
 		 126 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  68.25 
 
 		 128 aa  180  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  67.46 
 
 		 127 aa  179  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  70.87 
 
 		 126 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  70.87 
 
 		 126 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  70.87 
 
 		 126 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  71.65 
 
 		 126 aa  176  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  70.08 
 
 		 126 aa  176  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  69.05 
 
 		 127 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  69.11 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  69.29 
 
 		 126 aa  175  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  68.25 
 
 		 128 aa  175  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  70.87 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  69.29 
 
 		 126 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  68.5 
 
 		 126 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  67.72 
 
 		 126 aa  170  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  65.32 
 
 		 128 aa  168  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  65.08 
 
 		 130 aa  167  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  62.3 
 
 		 127 aa  164  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  63.64 
 
 		 128 aa  164  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  63.93 
 
 		 127 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  63.93 
 
 		 127 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  63.11 
 
 		 127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  62.3 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  60.94 
 
 		 128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  63.11 
 
 		 127 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  63.11 
 
 		 127 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  63.11 
 
 		 127 aa  161  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  63.11 
 
 		 127 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  64.52 
 
 		 127 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  61.48 
 
 		 127 aa  160  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  61.48 
 
 		 127 aa  160  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  63.78 
 
 		 128 aa  160  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  62.3 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  62.3 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0357  putative endoribonuclease L-PSP  62.3 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00527339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  62.3 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  60.16 
 
 		 128 aa  159  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  63.41 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  59.2 
 
 		 127 aa  157  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  57.81 
 
 		 128 aa  156  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  55.47 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  60.66 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  60.48 
 
 		 127 aa  154  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  59.68 
 
 		 126 aa  153  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  55.12 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  55.12 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  61.11 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1777  translation initiation inhibitor  60.32 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00398011  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0410  putative endoribonuclease L-PSP  59.52 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000330558  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  57.72 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  56.35 
 
 		 129 aa  143  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  54.33 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  53.54 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0470  endoribonuclease L-PSP  63.49 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.720081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2126  endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158455  hitchhiker  0.000014394 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 129 aa  136  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  48.48 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  44.88 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 140 aa  123  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 129 aa  120  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  53.39 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  47.29 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2314  YjgF-like protein  47.54 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 124 aa  117  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  48.76 
 
 		 135 aa  116  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  45.67 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  49.22 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  46.09 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  44.53 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  43.75 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  48.8 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  47.66 
 
 		 128 aa  110  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  47.46 
 
 		 124 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 		 128 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 129 aa  110  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>