More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1116 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1116  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 
493 aa  966    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1024  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  59.92 
 
 
500 aa  541  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.272198  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1465  NADH dehydrogenase subunit M  52.31 
 
 
510 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1805  NADH dehydrogenase subunit M  52.31 
 
 
510 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.168858 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1571  NADH dehydrogenase subunit M  52.31 
 
 
510 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1010  NADH dehydrogenase subunit M  51.81 
 
 
514 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2558  NADH dehydrogenase subunit M  51.1 
 
 
509 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1503  NADH dehydrogenase subunit M  52 
 
 
511 aa  501  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29860  NADH dehydrogenase subunit M  51.1 
 
 
509 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000573313  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1348  NADH dehydrogenase I, M subunit  60.74 
 
 
489 aa  497  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.467461  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1109  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  59.15 
 
 
505 aa  496  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2761  NADH dehydrogenase subunit M  51.9 
 
 
511 aa  496  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3297  NADH dehydrogenase subunit M  51.11 
 
 
509 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.416453 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02202  NADH dehydrogenase subunit M  50.9 
 
 
509 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.786903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.9 
 
 
509 aa  490  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28550  NADH dehydrogenase subunit M  51.91 
 
 
509 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2570  NADH dehydrogenase subunit M  50.9 
 
 
509 aa  490  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2653  NADH dehydrogenase subunit M  50.9 
 
 
509 aa  491  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3416  NADH dehydrogenase subunit M  50.9 
 
 
509 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2426  NADH dehydrogenase subunit M  50.9 
 
 
509 aa  490  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2539  NADH dehydrogenase subunit M  50.91 
 
 
511 aa  490  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1375  NADH dehydrogenase subunit M  50.9 
 
 
509 aa  490  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02162  hypothetical protein  50.9 
 
 
509 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2431  NADH dehydrogenase subunit M  50.9 
 
 
509 aa  490  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2501  NADH dehydrogenase subunit M  50.9 
 
 
509 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2663  NADH dehydrogenase subunit M  50.9 
 
 
509 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2545  NADH dehydrogenase subunit M  50.9 
 
 
509 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2456  NADH dehydrogenase subunit M  50.9 
 
 
509 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2556  NADH dehydrogenase subunit M  50.9 
 
 
509 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2423  NADH dehydrogenase subunit M  51.7 
 
 
509 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3121  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.99 
 
 
513 aa  484  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0441802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1405  NADH dehydrogenase subunit M  49.9 
 
 
532 aa  478  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3208  NADH dehydrogenase subunit M  53.11 
 
 
510 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281414  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2821  NADH dehydrogenase subunit M  51 
 
 
509 aa  474  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.43  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3376  NADH dehydrogenase I, M subunit  52.91 
 
 
510 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3614  NADH dehydrogenase subunit M  52.51 
 
 
510 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166771  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3814  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.4 
 
 
490 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0595  NADH dehydrogenase subunit M  49.22 
 
 
541 aa  463  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000354161  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1862  NADH dehydrogenase subunit M  52.89 
 
 
510 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  0.0328463 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0584  NADH dehydrogenase subunit M  49.22 
 
 
541 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2871  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.36 
 
 
537 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0408599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3702  NADH dehydrogenase subunit M  52.2 
 
 
510 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.65414  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4130  NADH dehydrogenase subunit M  52.2 
 
 
510 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1735  NADH dehydrogenase subunit M  52.2 
 
 
510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00591275  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0370  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.25 
 
 
507 aa  429  1e-119  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1688  NADH dehydrogenase subunit M  45.2 
 
 
577 aa  427  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.694136  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0707  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  55.37 
 
 
493 aa  414  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.296941  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0314  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.48 
 
 
493 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.12 
 
 
519 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.37 
 
 
525 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  45.18 
 
 
522 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3430  NADH dehydrogenase I, M subunit  44.37 
 
 
496 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.19 
 
 
535 aa  362  6e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0171  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.28 
 
 
496 aa  361  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.96 
 
 
535 aa  360  4e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  39.22 
 
 
510 aa  351  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.89 
 
 
542 aa  349  6e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.96 
 
 
497 aa  349  7e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.89 
 
 
542 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.01 
 
 
542 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.02 
 
 
535 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.92 
 
 
585 aa  343  5.999999999999999e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341288  normal  0.991992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.52 
 
 
517 aa  343  5.999999999999999e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4060  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.42 
 
 
480 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.40537  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3214  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.22 
 
 
514 aa  340  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1337  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.55 
 
 
481 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210293  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0168  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.44 
 
 
494 aa  339  8e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  39.65 
 
 
512 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  41.01 
 
 
502 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  41.01 
 
 
502 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  40.7 
 
 
503 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  39.87 
 
 
503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  39.87 
 
 
503 aa  336  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1358  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.88 
 
 
481 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199626  normal  0.187922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0150  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.93 
 
 
495 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  40.77 
 
 
502 aa  335  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4732  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.67 
 
 
480 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708423  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  37.67 
 
 
501 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  38.98 
 
 
502 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3625  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.5 
 
 
491 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  39.57 
 
 
489 aa  327  3e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  38.68 
 
 
505 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.76 
 
 
495 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  41.37 
 
 
494 aa  325  9e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4155  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.66 
 
 
534 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0166298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  39.53 
 
 
505 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  38.46 
 
 
502 aa  323  5e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  38.68 
 
 
505 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1295  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.59 
 
 
559 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.09 
 
 
494 aa  319  9e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  39.09 
 
 
494 aa  319  9e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0754  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.52 
 
 
501 aa  319  9e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  38.89 
 
 
514 aa  319  9e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1073  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.33 
 
 
527 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.397792  normal  0.614174 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0759  NADH dehydrogenase subunit M  36.46 
 
 
521 aa  318  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1248  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.11 
 
 
534 aa  317  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130648  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1202  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.33 
 
 
527 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.29 
 
 
503 aa  317  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1007  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.14 
 
 
527 aa  317  4e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244989  normal  0.172272 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0876  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.75 
 
 
502 aa  316  5e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000201559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>