109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1106 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1106  plasmid maintenance system killer  100 
 
 
95 aa  202  9e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.458841  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1061  plasmid maintenance system killer  58.06 
 
 
93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000720973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1907  plasmid maintenance system killer  54.84 
 
 
93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000193605  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2880  plasmid maintenance system killer  51.61 
 
 
93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27680  Plasmid maintenance system killer protein  51.61 
 
 
93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0413  plasmid maintenance system killer  49.46 
 
 
93 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2941  plasmid maintenance system killer  50.54 
 
 
94 aa  107  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00442539  hitchhiker  0.00124461 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03904  plasmid maintenance system killer protein  47.31 
 
 
93 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3199  plasmid maintenance system killer  53.76 
 
 
92 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3425  plasmid maintenance system killer  48.39 
 
 
105 aa  103  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.835038  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1092  hypothetical protein  49.46 
 
 
93 aa  103  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4369  plasmid maintenance system killer  50.54 
 
 
94 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0624655  normal  0.0363881 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2020  plasmid maintenance system killer  50.54 
 
 
93 aa  101  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2694  plasmid maintenance system killer  49.46 
 
 
99 aa  100  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4677  plasmid maintenance system killer  46.24 
 
 
93 aa  99.4  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0978715  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0044  plasmid maintenance system killer  50.54 
 
 
92 aa  99.4  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1215  plasmid maintenance system killer  48.39 
 
 
93 aa  98.6  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0607  plasmid maintenance system killer  47.31 
 
 
93 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2973  plasmid maintenance system killer  51.61 
 
 
92 aa  98.6  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2895  plasmid maintenance system killer  50.54 
 
 
92 aa  97.8  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.541001 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0767  plasmid maintenance system killer  49.46 
 
 
93 aa  97.1  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0223  plasmid maintenance system killer  47.31 
 
 
92 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.642238  normal  0.270748 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1668  plasmid maintenance system killer  48.39 
 
 
92 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.856327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4191  plasmid maintenance system killer  44.09 
 
 
92 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0717347  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3069  plasmid maintenance system killer  47.31 
 
 
93 aa  94.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3936  plasmid maintenance system killer  46.24 
 
 
93 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0902  hypothetical protein  45.16 
 
 
199 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1586  killer protein, putative  43.01 
 
 
92 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2851  plasmid maintenance system killer  45.16 
 
 
93 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3242  plasmid maintenance system killer  44.68 
 
 
94 aa  90.9  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0554672  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5480  plasmid maintenance system killer  45.16 
 
 
91 aa  90.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2762  plasmid maintenance system killer  46.24 
 
 
92 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0020  plasmid maintenance system killer  47.31 
 
 
92 aa  88.6  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184323  normal  0.0200834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1212  plasmid maintenance system killer  45.65 
 
 
93 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3226  plasmid maintenance system killer  45.16 
 
 
95 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6219  plasmid maintenance system killer  47.31 
 
 
93 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1124  plasmid maintenance system killer  45.16 
 
 
93 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.178606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3069  plasmid maintenance system killer  47.31 
 
 
92 aa  87.8  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67304  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3186  plasmid maintenance system killer  45.16 
 
 
93 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0260939  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0534  AAA family ATPase  44.09 
 
 
112 aa  87  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.943308  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0643  hypothetical protein  39.78 
 
 
94 aa  86.3  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000101357  normal  0.456148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2928  plasmid maintenance system killer  44.09 
 
 
93 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.133815  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0416  plasmid maintenance system killer  45.16 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1670  plasmid maintenance system killer protein  43.01 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.137882  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6420  plasmid maintenance system killer  45.16 
 
 
95 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.953679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4917  plasmid maintenance system killer  39.78 
 
 
93 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.131575 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1488  hypothetical protein  41.94 
 
 
93 aa  84.3  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000964732  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4147  plasmid maintenance system killer  44.09 
 
 
92 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.813098  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1386  plasmid maintenance system killer  44.09 
 
 
92 aa  84  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0273  plasmid maintenance system killer  39.78 
 
 
95 aa  82  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1376  plasmid maintenance system killer  39.78 
 
 
93 aa  82  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2105  plasmid maintenance system killer  40.86 
 
 
93 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4827  plasmid maintenance system killer  43.01 
 
 
92 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4763  plasmid maintenance system killer  36.96 
 
 
94 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.561409 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2890  plasmid maintenance system killer  43.01 
 
 
92 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.320919  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4140  plasmid maintenance system killer  47.31 
 
 
92 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543645  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0213  proteic killer protein, putative  40.86 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359466  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1424  plasmid maintenance system killer  38.04 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4132  plasmid maintenance system killer  51.56 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0858239  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3615  plasmid maintenance system killer  45.74 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.443505  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4028  plasmid maintenance system killer  40 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2030  plasmid maintenance system killer  36.08 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2763  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 
95 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.686339  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0570  plasmid maintenance system killer  39.78 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2424  plasmid maintenance system killer  34.41 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228875  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0423  proteic killer protein, putative  38.71 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2830  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0714148  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2470  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3084  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2424  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6434  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0275  plasmid maintenance system killer  37.04 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.292531  normal  0.0660179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2650  plasmid maintenance system killer  37.04 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.839642  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0833  plasmid maintenance system killer  34.74 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.463339  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1454  plasmid maintenance system killer  37.63 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.046849  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3184  plasmid maintenance system killer  36.96 
 
 
104 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5381  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0821109  hitchhiker  0.0023513 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0438  plasmid maintenance system killer  34.41 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.275617  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0673  plasmid maintenance system killer protein  54.76 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.139891  normal  0.666282 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0930  putative killer protein  36.47 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3644  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.018062  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4499  plasmid maintenance system killer  30.77 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.538782 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1064  plasmid maintenance system killer  34.94 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1591  plasmid maintenance system killer  32.26 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0593652  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1257  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0146502 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0090  plasmid maintenance system killer  32.26 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0088  plasmid maintenance system killer protein  32.26 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.167827  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3242  plasmid maintenance system killer  31.18 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0235263  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4450  plasmid maintenance system killer  34.41 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4746  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4755  plasmid maintenance system killer  40.62 
 
 
76 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2525  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385554  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2504  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000281555  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3837  plasmid maintenance system killer  34.41 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1124  plasmid maintenance system killer  30.11 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000991255  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6999  plasmid maintenance system killer  30.53 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17446  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0404  proteic killer suppression protein  34.04 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1143  proteic killer suppression protein  34.04 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3764  plasmid maintenance system killer  39.34 
 
 
61 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0360  plasmid maintenance system killer  34.04 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>