More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1062 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1062  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 		 744 aa  1503    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171253  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.07 
 
 		 758 aa  195  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  25.86 
 
 		 701 aa  192  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.27 
 
 		 696 aa  183  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  26 
 
 		 794 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  26.84 
 
 		 696 aa  154  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  34.8 
 
 		 701 aa  148  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  25.5 
 
 		 614 aa  146  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  28.03 
 
 		 746 aa  144  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  34 
 
 		 701 aa  144  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  33.86 
 
 		 702 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  32.95 
 
 		 726 aa  140  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  32.81 
 
 		 724 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  25.94 
 
 		 638 aa  133  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.08 
 
 		 656 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  30.83 
 
 		 593 aa  130  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 		 903 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  23.4 
 
 		 641 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 		 864 aa  127  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  25.21 
 
 		 752 aa  125  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  32.3 
 
 		 797 aa  122  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.96 
 
 		 672 aa  122  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  25.68 
 
 		 744 aa  122  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.14 
 
 		 761 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  34.96 
 
 		 651 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  28.92 
 
 		 861 aa  119  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  33.97 
 
 		 675 aa  118  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  29.69 
 
 		 741 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  29.72 
 
 		 860 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  30.27 
 
 		 712 aa  116  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.72 
 
 		 648 aa  115  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 		 721 aa  115  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.95 
 
 		 858 aa  115  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23 
 
 		 611 aa  114  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.84 
 
 		 657 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.31 
 
 		 656 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  29.08 
 
 		 859 aa  114  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 		 643 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  29.86 
 
 		 729 aa  112  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.29 
 
 		 737 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  31.6 
 
 		 717 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.83 
 
 		 703 aa  111  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  36.72 
 
 		 681 aa  110  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  34.81 
 
 		 284 aa  110  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  28.21 
 
 		 667 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  28.27 
 
 		 694 aa  109  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  27.91 
 
 		 936 aa  109  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  28.46 
 
 		 758 aa  109  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  36.16 
 
 		 670 aa  109  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  23.8 
 
 		 758 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  27.31 
 
 		 734 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  30.86 
 
 		 713 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  34.64 
 
 		 699 aa  107  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.87 
 
 		 652 aa  106  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.48 
 
 		 650 aa  105  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  29.41 
 
 		 358 aa  104  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.43 
 
 		 754 aa  105  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.45 
 
 		 637 aa  104  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  29.06 
 
 		 607 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  28.88 
 
 		 645 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  27.04 
 
 		 632 aa  102  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  32.09 
 
 		 643 aa  101  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  34.03 
 
 		 911 aa  101  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  28.08 
 
 		 364 aa  100  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.48 
 
 		 643 aa  100  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.49 
 
 		 678 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  33.87 
 
 		 636 aa  99  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  29.33 
 
 		 1093 aa  99  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  27.09 
 
 		 645 aa  98.2  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.15 
 
 		 764 aa  97.8  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  30.94 
 
 		 760 aa  97.8  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  29.61 
 
 		 483 aa  97.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  29.61 
 
 		 483 aa  97.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28 
 
 		 701 aa  97.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  27.2 
 
 		 1133 aa  97.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  26.8 
 
 		 1130 aa  96.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  30.6 
 
 		 421 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  26.11 
 
 		 650 aa  96.3  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  28.39 
 
 		 1119 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  31.9 
 
 		 421 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  28.29 
 
 		 665 aa  96.3  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  32.77 
 
 		 483 aa  95.9  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  30.43 
 
 		 759 aa  95.1  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  30.28 
 
 		 518 aa  94.4  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  30.14 
 
 		 404 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 		 740 aa  92.4  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  28.32 
 
 		 971 aa  91.7  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  30.39 
 
 		 756 aa  91.7  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.39 
 
 		 753 aa  91.3  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.14 
 
 		 758 aa  90.9  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  31.35 
 
 		 641 aa  90.5  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.67 
 
 		 500 aa  89.7  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  29.82 
 
 		 515 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2916  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.41 
 
 		 575 aa  89  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0753379  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  29.84 
 
 		 969 aa  88.2  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  26.53 
 
 		 731 aa  87  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  30.65 
 
 		 729 aa  86.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  23.69 
 
 		 725 aa  86.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  30.56 
 
 		 523 aa  86.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.72 
 
 		 658 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>