254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0889 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0889  multicopper oxidase, type 3  100 
 
 
151 aa  314  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000356897  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  47.92 
 
 
358 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  46.88 
 
 
358 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  40.66 
 
 
364 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  34.81 
 
 
360 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06635  Laccase-1 Precursor (EC 1.10.3.2)(Laccase I)(Benzenediol:oxygen oxidoreductase 1)(Urishiol oxidase 1)(Diphenol oxidase 1)(Conidial laccase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P17489]  33.87 
 
 
609 aa  65.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal  0.279078 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00878  conserved hypothetical protein: extracellular laccase (Eurofung)  36.36 
 
 
596 aa  65.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  30.91 
 
 
565 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  31.96 
 
 
680 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  35.23 
 
 
444 aa  60.5  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  35.11 
 
 
1064 aa  60.1  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05397  conserved hypothetical protein: extracellular laccase (Eurofung)  33.33 
 
 
664 aa  60.1  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.436415  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00901  Laccase Precursor (EC 1.10.3.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VT5]  30.77 
 
 
601 aa  59.7  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  35.35 
 
 
464 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  35.35 
 
 
464 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  35.42 
 
 
505 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  34.41 
 
 
803 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  31.31 
 
 
592 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  29.41 
 
 
460 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  38.04 
 
 
455 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  38.04 
 
 
455 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  32.08 
 
 
630 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  34.74 
 
 
561 aa  57.8  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  32.38 
 
 
460 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  29.7 
 
 
457 aa  57  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2590  multicopper oxidase, type 3  35.56 
 
 
526 aa  57  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.238338  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  32.26 
 
 
521 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  28.24 
 
 
551 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  35.63 
 
 
627 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  28.37 
 
 
564 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  29.47 
 
 
508 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  34.31 
 
 
373 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  33 
 
 
606 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  33 
 
 
607 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  36.96 
 
 
477 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  34.69 
 
 
359 aa  53.9  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  32 
 
 
574 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  34.44 
 
 
640 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  31.96 
 
 
554 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  32 
 
 
566 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  35.87 
 
 
471 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  34.78 
 
 
470 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  28.16 
 
 
609 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  33.7 
 
 
459 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  31.58 
 
 
621 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  31.96 
 
 
554 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  31.18 
 
 
521 aa  52.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  32.18 
 
 
640 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  31 
 
 
656 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  34.78 
 
 
470 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  34.78 
 
 
471 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  35.9 
 
 
508 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1810  multicopper oxidase, type 3  34.31 
 
 
488 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  34.78 
 
 
470 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  32.18 
 
 
604 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  35.87 
 
 
470 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  34.78 
 
 
470 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09170  conserved hypothetical protein: exracellular laccase (Eurofung)  32.98 
 
 
570 aa  51.2  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  30.93 
 
 
606 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  30.19 
 
 
673 aa  51.2  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  35.87 
 
 
433 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  31.76 
 
 
477 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  29.82 
 
 
580 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  28.87 
 
 
551 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  33.67 
 
 
462 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  30.93 
 
 
546 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  33.33 
 
 
431 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  35.87 
 
 
460 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  34.78 
 
 
463 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  33.67 
 
 
462 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  31 
 
 
572 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  30.93 
 
 
546 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  35.87 
 
 
443 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  32.26 
 
 
317 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  32.26 
 
 
621 aa  50.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  34.78 
 
 
431 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  29.17 
 
 
460 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  27.47 
 
 
504 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  35.87 
 
 
431 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  31.03 
 
 
506 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  31.03 
 
 
633 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  28.95 
 
 
669 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  28.87 
 
 
551 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01240  laccase precursor, putative  30.34 
 
 
624 aa  49.7  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  32.61 
 
 
452 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  33.7 
 
 
431 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  33.7 
 
 
431 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  28.87 
 
 
551 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  29.21 
 
 
535 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  28.87 
 
 
549 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  33.7 
 
 
467 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  33.7 
 
 
431 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  33.7 
 
 
467 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  33.7 
 
 
470 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  33.7 
 
 
431 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  33.7 
 
 
431 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  33.7 
 
 
431 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  31.03 
 
 
630 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  29.47 
 
 
626 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  28.95 
 
 
652 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>