222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0870 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0870  RNA-binding S4  100 
 
 		 132 aa  268  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.774132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1959  RNA-binding S4 domain protein  59.06 
 
 		 167 aa  144  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0257024  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2308  hypothetical protein  50.39 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3621  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.56 
 
 		 130 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0308418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4360  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4736  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.2 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00728557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3778  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  50.41 
 
 		 133 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3872  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  50.41 
 
 		 133 aa  121  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1265  RNA-binding S4  51.54 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0313  RNA-binding S4 domain protein  49.59 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3596  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  49.59 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4705  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  49.59 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.39239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  52.8 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3678  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  49.59 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479283 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0313  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  49.59 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0933812 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0142  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.39 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0149  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.41 
 
 		 132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3696  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  49.59 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.8 
 
 		 130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3813  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  45.53 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03252  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  48.78 
 
 		 133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03204  hypothetical protein  48.78 
 
 		 133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3752  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.23 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05160  heat shock protein implicated in 50S component recycling (S4 paralogue)  53.28 
 
 		 130 aa  117  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0946751  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3694  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  49.59 
 
 		 133 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3769  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  49.59 
 
 		 133 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.594721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3894  RNA-binding S4 domain protein  48.82 
 
 		 136 aa  116  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0164  heat shock protein 15  47.62 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3866  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  48.76 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3803  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  48.76 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0490537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4071  RNA-binding S4 domain protein  48.03 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3569  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0348447  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0149  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.83 
 
 		 132 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0167  heat shock protein 15  48.76 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0728996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0509  RNA-binding S4 protein  50.39 
 
 		 134 aa  114  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.916368  normal  0.173554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0150  RNA-binding S4 domain protein  47.2 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0151  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.2 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.245693 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0154  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.03 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.29084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0147  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.2 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834314  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2659  RNA-binding S4  51.59 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.793293  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4208  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.2 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0328  RNA-binding S4 domain protein  48.33 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  48.39 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1649  heat shock protein 15  48.36 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00599  heat shock protein  44.88 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4615  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.36 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0365  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.06 
 
 		 170 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0249  RNA-binding S4 domain protein  48.33 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3976  heat shock protein 15  47.2 
 
 		 135 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0176  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.2 
 
 		 135 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.905823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3737  heat shock protein 15  47.2 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0103  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.67 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0119  RNA-binding S4  47.66 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0359647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68630  putative heat shock protein  52.94 
 
 		 131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1817  heat shock protein 15  54.55 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5939  putative heat shock protein  52.1 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0884  RNA-binding S4 domain protein  51.72 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0237  heat shock protein 15  48.39 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2496  putative heat shock protein  46.92 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0776  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.15 
 
 		 142 aa  107  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00252001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0265  RNA-binding S4  46.83 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.88 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  48.39 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4962  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.59 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0275  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.58 
 
 		 133 aa  105  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0250  RNA-binding S4 domain protein  48.74 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0157296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0170  RNA-binding S4  45.97 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0265  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.74 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.664213 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0095  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.76 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0019  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.97 
 
 		 138 aa  103  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.329407  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2926  heat shock protein 15  45.31 
 
 		 133 aa  103  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4593  heat shock protein 15  45.83 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  46.22 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0950  heat shock RNA-binding protein  45.31 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2640  RNA-binding S4  46.15 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414836  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  61.25 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1173  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.53 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.38 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2876  RNA-binding S4 domain protein  43.75 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1304  heat shock protein 15  44.96 
 
 		 135 aa  98.6  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1468  RNA-binding S4  44.36 
 
 		 146 aa  98.6  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.369867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3977  RNA-binding S4  48.33 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0228  RNA-binding S4  42.62 
 
 		 138 aa  98.6  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1162  RNA-binding S4 domain protein  48 
 
 		 135 aa  98.6  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  45.16 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2470  RNA-binding S4 domain protein  42.97 
 
 		 132 aa  97.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  45.74 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.74 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3836  RNA-binding S4  44.96 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  44 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.55 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0717  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.96 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03954  heat shock protein 15  42.62 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3325  heat shock protein 15  43.41 
 
 		 135 aa  94  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0016  RNA-binding S4  42.5 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0497  heat shock protein 15  43.41 
 
 		 135 aa  94  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.673566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1102  heat shock protein 15  43.41 
 
 		 135 aa  94  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3281  heat shock protein 15  43.41 
 
 		 135 aa  94  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3314  heat shock protein 15  43.41 
 
 		 135 aa  94  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2209  heat shock protein 15  43.41 
 
 		 135 aa  94  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>