More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0810 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  100 
 
 
243 aa  489  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  69.23 
 
 
245 aa  348  3e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  66.95 
 
 
242 aa  340  9e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  66.1 
 
 
242 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  65.38 
 
 
239 aa  333  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  66.52 
 
 
246 aa  331  7.000000000000001e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  68.51 
 
 
242 aa  325  5e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  66.24 
 
 
243 aa  322  5e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  67.38 
 
 
240 aa  321  7e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  65.81 
 
 
243 aa  318  3e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  61.92 
 
 
247 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  60 
 
 
246 aa  308  5.9999999999999995e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  61.83 
 
 
249 aa  307  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  61.76 
 
 
247 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  61.76 
 
 
247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  61.76 
 
 
247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  61.97 
 
 
245 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  62.29 
 
 
241 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  62.29 
 
 
241 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  61.86 
 
 
247 aa  301  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  61.86 
 
 
246 aa  301  9e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  61.97 
 
 
245 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2974  uridylate kinase  61.18 
 
 
249 aa  300  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  61.37 
 
 
240 aa  298  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  61.54 
 
 
242 aa  297  9e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  61.18 
 
 
247 aa  297  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  59.15 
 
 
274 aa  296  2e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1103  uridylate kinase  61.02 
 
 
247 aa  295  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.637012  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0565  uridylate kinase  62.29 
 
 
253 aa  295  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2595  uridylate kinase  60.52 
 
 
247 aa  295  6e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151239  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  61.54 
 
 
247 aa  294  9e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  61.97 
 
 
247 aa  293  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1555  uridylate kinase  59.92 
 
 
247 aa  293  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  58.37 
 
 
238 aa  292  3e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  59.57 
 
 
240 aa  292  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  59.15 
 
 
240 aa  291  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  58.3 
 
 
239 aa  291  9e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  59.66 
 
 
240 aa  290  1e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  57.56 
 
 
239 aa  289  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  60.68 
 
 
241 aa  289  3e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  59.32 
 
 
241 aa  289  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  59.32 
 
 
241 aa  289  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3788  uridylate kinase  59.32 
 
 
241 aa  289  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  59.83 
 
 
247 aa  289  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  59.15 
 
 
240 aa  289  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  60.26 
 
 
245 aa  289  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  58.9 
 
 
241 aa  288  4e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1272  uridylate kinase  59.49 
 
 
245 aa  288  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00989068  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  58.62 
 
 
236 aa  288  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  59.07 
 
 
245 aa  288  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3279  uridylate kinase  60.26 
 
 
245 aa  288  8e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00055393  hitchhiker  0.000297429 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  58.62 
 
 
235 aa  288  8e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  58.55 
 
 
239 aa  288  8e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  56.96 
 
 
239 aa  287  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  57.56 
 
 
239 aa  286  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  58.62 
 
 
242 aa  286  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  58.62 
 
 
242 aa  286  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1556  uridylate kinase  59.75 
 
 
243 aa  286  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249994  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  58.05 
 
 
245 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0943  uridylate kinase  58.47 
 
 
241 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00384678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  58.05 
 
 
251 aa  285  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  57.51 
 
 
238 aa  285  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  58.05 
 
 
251 aa  285  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  58.05 
 
 
251 aa  285  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  58.97 
 
 
245 aa  284  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  58.97 
 
 
245 aa  284  7e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  58.97 
 
 
245 aa  284  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  58.97 
 
 
245 aa  284  7e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  57.69 
 
 
239 aa  284  8e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3358  uridylate kinase  58.47 
 
 
241 aa  284  8e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.386876  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  57.96 
 
 
249 aa  284  8e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3163  uridylate kinase  57.81 
 
 
243 aa  284  9e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  58.01 
 
 
236 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  56.65 
 
 
239 aa  283  1.0000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  54.62 
 
 
240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2813  uridylate kinase  58.72 
 
 
242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000178948  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  58.87 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  55.7 
 
 
239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2639  uridylate kinase  58.55 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000176881  normal  0.106095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2706  uridylate kinase  58.55 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000157467  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  57.87 
 
 
239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  57.58 
 
 
286 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2883  uridylate kinase  58.3 
 
 
242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000941193  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  58.87 
 
 
240 aa  281  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  54.66 
 
 
244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1849  uridylate kinase  61.28 
 
 
243 aa  282  4.0000000000000003e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242917  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  57.87 
 
 
242 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  57.58 
 
 
237 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  57.58 
 
 
237 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  57.58 
 
 
237 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  57.58 
 
 
237 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  57.58 
 
 
237 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  57.58 
 
 
237 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  57.14 
 
 
245 aa  281  5.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  57.58 
 
 
237 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  58.01 
 
 
253 aa  281  6.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  56.12 
 
 
239 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2979  uridylate kinase  58.23 
 
 
243 aa  281  7.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  56.47 
 
 
234 aa  281  9e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  57.58 
 
 
237 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>