More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0780 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 243 aa  500  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  66.24 
 
 		 247 aa  315  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  61.97 
 
 		 247 aa  305  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  39.13 
 
 		 217 aa  168  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  42.86 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  42.36 
 
 		 217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  42.47 
 
 		 220 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  39.71 
 
 		 214 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  33.96 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  32.37 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  36.27 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 222 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  37.75 
 
 		 225 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 		 227 aa  89.4  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  31.19 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  26.86 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  30.48 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  33.18 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  30.18 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  31.55 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  30.89 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  31.37 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  31.65 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  29 
 
 		 389 aa  75.9  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  29.8 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  30.54 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  30.97 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  31.45 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  27.59 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  31.03 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  38.79 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  34.45 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  28.79 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  29.51 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  30.82 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  31.12 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  30.53 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  26.46 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30.72 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  26.17 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  30.93 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  32.17 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  30.57 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  27.09 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  31.34 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  32.28 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  34.75 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  36.44 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  29.11 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  29.11 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  34.75 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  34.75 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  34.75 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  29.11 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  31.58 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  30.26 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  32.17 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  29.68 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  29.27 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  31.25 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  27.1 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  32 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  33.05 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 187 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  30.14 
 
 		 193 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  35.83 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  31.87 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  29.75 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  30.83 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  30.83 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  29.02 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  30.83 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  28.67 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  27.92 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>