More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0675 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
459 aa  918  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  4.58656e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.92 
 
 
389 aa  297  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  50 
 
 
452 aa  280  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
445 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  34.13 
 
 
455 aa  260  4e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  34.13 
 
 
455 aa  259  6e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 
454 aa  243  4e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
419 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  35.04 
 
 
449 aa  240  3e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.10804e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
420 aa  241  3e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
449 aa  240  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  35.04 
 
 
449 aa  239  6e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
442 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  35.91 
 
 
465 aa  236  9e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
421 aa  235  1e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  36.44 
 
 
416 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
469 aa  233  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.56 
 
 
467 aa  230  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  46.53 
 
 
412 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  34.48 
 
 
480 aa  225  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  42.19 
 
 
465 aa  223  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  44.85 
 
 
381 aa  221  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
455 aa  219  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  35.22 
 
 
458 aa  217  3e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  34.19 
 
 
456 aa  216  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
446 aa  216  1e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
446 aa  214  2e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  5.01512e-05  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  39.2 
 
 
472 aa  214  2e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  42.32 
 
 
453 aa  213  6e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  32.23 
 
 
462 aa  210  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
446 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  3.35712e-10 
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  45.1 
 
 
365 aa  210  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
435 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  9.971e-12 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
440 aa  206  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  33.48 
 
 
429 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
446 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  1.82562e-05 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  33.68 
 
 
446 aa  202  1e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 
455 aa  202  1e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
429 aa  201  2e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
458 aa  201  2e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  33.75 
 
 
449 aa  201  2e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  2.6524e-09 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
449 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
449 aa  200  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  32.39 
 
 
449 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
455 aa  199  8e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  4.04182e-09 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  39.42 
 
 
453 aa  199  9e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
458 aa  199  1e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  33.96 
 
 
458 aa  197  2e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  1.37847e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
454 aa  197  5e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  34.47 
 
 
457 aa  196  8e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
446 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
570 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  31.03 
 
 
471 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  38.6 
 
 
471 aa  194  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
457 aa  193  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
471 aa  192  8e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  40.71 
 
 
449 aa  192  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
459 aa  189  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.34801e-06  unclonable  3.36351e-08 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  31.39 
 
 
450 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  40.93 
 
 
468 aa  186  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
443 aa  185  1e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.957037 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 
449 aa  185  1e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  39.29 
 
 
464 aa  184  2e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0194  two-component system sensor protein, histidine kinase  34.93 
 
 
461 aa  184  2e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0627121  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 
362 aa  183  5e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0747597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
439 aa  183  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2265  two-component sensor protein  40.71 
 
 
464 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.6955e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  37 
 
 
458 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 
466 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  37 
 
 
458 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  37 
 
 
458 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
449 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4811  two-component sensor protein  37.54 
 
 
457 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  33.45 
 
 
457 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  39.66 
 
 
457 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  39.66 
 
 
457 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  39.66 
 
 
457 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  39.66 
 
 
457 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  39.66 
 
 
457 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  39.66 
 
 
457 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 
444 aa  177  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  39.66 
 
 
457 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  39.66 
 
 
457 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  39.32 
 
 
457 aa  176  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  38.98 
 
 
457 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  38.98 
 
 
457 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  38.98 
 
 
457 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.60495e-07 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  38.98 
 
 
457 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  38.98 
 
 
457 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4061  two-component sensor protein  40.22 
 
 
457 aa  175  1e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000114618  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  39.21 
 
 
456 aa  174  4e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  39.07 
 
 
445 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  38.85 
 
 
456 aa  173  6e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  32.44 
 
 
468 aa  172  9e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  39.43 
 
 
445 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2302  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
450 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0020202  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  38.49 
 
 
456 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4065  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
463 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860107  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
448 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1224  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 
563 aa  169  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.600367  normal  0.164924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>