114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0617 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  100 
 
 		 225 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  39.07 
 
 		 224 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  44.97 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  33.98 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  42.4 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  40.91 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  41.79 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  41.79 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  38.46 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  40.46 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  38.89 
 
 		 216 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  42.62 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  33.85 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  33.85 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  34.81 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  29.33 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  38.71 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 222 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  38.17 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  36.29 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  37.6 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  32.93 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  35.34 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  32.34 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  36 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  35.61 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  26.83 
 
 		 216 aa  72  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  33.09 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  37.04 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  31.85 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  31.5 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2172  hypothetical protein  42.53 
 
 		 126 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  30.46 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  35.11 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  38.64 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  33.66 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  33.66 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  27.48 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  30.95 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  30.95 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0666  hypothetical protein  42.03 
 
 		 147 aa  54.7  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0895819  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  30.16 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  27.5 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  30.5 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  28.93 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  34.83 
 
 		 150 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  34.78 
 
 		 120 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  27.69 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  26.24 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  34.88 
 
 		 138 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.83 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  28.46 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  33.72 
 
 		 138 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  25.48 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1234  putative prophage repressor  30 
 
 		 153 aa  48.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000530915  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  33.72 
 
 		 143 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  33.72 
 
 		 138 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  29.13 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  33.33 
 
 		 137 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  27.67 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  26.13 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  36.44 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2008  LexA repressor  33.61 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  27.91 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0002  ultraviolet light resistance protein A  35.63 
 
 		 141 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  27.27 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  39.06 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  26.4 
 
 		 206 aa  45.8  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  30.93 
 
 		 151 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  27.89 
 
 		 240 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  27.89 
 
 		 240 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2782  LexA repressor  28.8 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0386684  hitchhiker  0.000588647 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 234 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  36.52 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0191  hypothetical protein  27.91 
 
 		 215 aa  45.1  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  28.46 
 
 		 208 aa  45.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  32.22 
 
 		 143 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  34.53 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0559  peptidase S24 and S26 domain protein  32.18 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  26.45 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  26.47 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  25.93 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  25.93 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2911  putative phage repressor  31.31 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204879  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  31.52 
 
 		 150 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2167  LexA repressor  34.65 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  29.9 
 
 		 151 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  26.45 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  29.11 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  30.93 
 
 		 154 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>