97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0569 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0569  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 		 117 aa  235  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0570  putative transcriptional regulator  86.67 
 
 		 108 aa  183  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.266064 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1222  putative transcriptional regulator  88.54 
 
 		 98 aa  174  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2965  putative transcriptional regulator  89.58 
 
 		 97 aa  174  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2273  putative transcriptional regulator  85.42 
 
 		 104 aa  174  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.59537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2534  putative transcriptional regulator  88.54 
 
 		 98 aa  174  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050533 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2877  addiction module antidote protein  87.5 
 
 		 97 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1542  Cro/CI family transcriptional regulator  88.54 
 
 		 97 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395246  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0237  putative transcriptional regulator  77.66 
 
 		 100 aa  151  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40590  transcriptional regulator protein  70.83 
 
 		 102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0420  transcriptional regulator  72.73 
 
 		 95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.461361  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5507  putative transcriptional regulator  68.82 
 
 		 99 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.366583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4952  putative transcriptional regulator  67.02 
 
 		 99 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3780  putative transcriptional regulator  67.74 
 
 		 99 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.798445  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3743  putative transcriptional regulator  67.74 
 
 		 99 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.643331 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3672  putative transcriptional regulator  67.74 
 
 		 99 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.932392  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4583  putative transcriptional regulator  66.67 
 
 		 99 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205891  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2314  putative transcriptional regulator  65.96 
 
 		 99 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1725  putative transcriptional regulator  67.37 
 
 		 97 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149622  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1332  putative transcriptional regulator  60.61 
 
 		 99 aa  123  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.043655 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1631  hypothetical protein  59.6 
 
 		 99 aa  120  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.605543  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05545  hypothetical protein  61.8 
 
 		 99 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0898  putative transcriptional regulator  65.59 
 
 		 96 aa  117  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368951  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4018  putative transcriptional regulator  53.76 
 
 		 106 aa  106  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3155  putative transcriptional regulator  55.32 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6313  addiction module antidote protein  55.79 
 
 		 97 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0276744  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4949  putative transcriptional regulator  59.77 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554909  normal  0.473555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1686  putative transcriptional regulator  56.52 
 
 		 98 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6941  putative transcriptional regulator  57.47 
 
 		 99 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15575  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2824  addiction module antidote protein  53.26 
 
 		 101 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96791  normal  0.589789 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1254  putative transcriptional regulator  51.61 
 
 		 101 aa  98.6  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2207  putative transcriptional regulator  56.32 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0141  putative transcriptional regulator  54.55 
 
 		 99 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.389686  hitchhiker  0.00339535 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0449  hypothetical protein  51.69 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144343  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3174  putative transcriptional regulator  53.19 
 
 		 95 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2537  putative transcriptional regulator  55.17 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.35922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3989  hypothetical protein  51.11 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0366  putative transcriptional regulator  48.94 
 
 		 104 aa  89.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4548  putative transcriptional regulator  49.46 
 
 		 100 aa  89.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0184  putative transcriptional regulator  48.39 
 
 		 94 aa  87.8  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.57004  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0861  transcriptional regulator  47.87 
 
 		 100 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.11203 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2993  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 92 aa  87  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0500  putative transcriptional regulator  47.37 
 
 		 100 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3881  putative transcriptional regulator  45.92 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.26577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0829  hypothetical protein  51.76 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00761962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4037  putative transcriptional regulator  46.81 
 
 		 97 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42157 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0040  addiction module antidote protein  48.45 
 
 		 95 aa  84.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0856  putative transcriptional regulator  50.59 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.623315 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0456  transcriptional regulator  46.74 
 
 		 95 aa  84  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3926  putative transcriptional regulator  51.72 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.511666 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0573  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 101 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.278814 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8270  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0213067  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0171  addiction module antidote protein  50 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1150  hypothetical protein  51.72 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3082  transcriptional regulator  49.44 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2007  transcriptional regulator  46.32 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0051  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2670  putative transcriptional regulator  47.67 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19306  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1443  putative transcriptional regulator  48.28 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0224  putative transcriptional regulator  46.51 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0606  addiction module antidote protein  43.02 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1305  transcriptional regulator  44.57 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.148881  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3744  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255899  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1983  putative transcriptional regulator  42.55 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1303  putative transcriptional regulator  41.24 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3267  addiction module antidote protein  55.74 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1734  hypothetical protein  42.11 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1241  hypothetical protein  43.68 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0372101  normal  0.605279 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1424  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.356801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0174  putative addiction module antidote protein  41.57 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1271  putative transcriptional regulator  42.53 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.666543 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1295  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.053916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0146  addiction module antidote protein  41.67 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1813  hypothetical protein  41.67 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6535  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3123  putative transcriptional regulator  47.13 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1201  addiction module antidote protein  40.7 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000259095  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1426  addiction module antidote protein  40.7 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00137891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2242  putative transcriptional regulator  41.05 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1155  putative transcriptional regulator  55.93 
 
 		 275 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163993  unclonable  0.000000164707 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2280  transcriptional regulator-like  48.44 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal  0.372156 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0282  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1488  putative transcriptional regulator  47.37 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.3464  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9109  hypothetical protein  51.32 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.689253  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3934  putative transcriptional regulator  42.7 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148874 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2621  putative transcriptional regulator  39.51 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3002  addiction module antidote protein  37.21 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2079  putative transcriptional regulator  32.95 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5375  hypothetical protein  32.14 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00339875  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5333  putative transcriptional regulator  39.53 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3502  putative transcriptional regulator  41.1 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387037  hitchhiker  0.00960025 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0368  addiction module antidote protein  43.96 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235004 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2517  putative transcriptional regulator  40.26 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3598  putative transcriptional regulator  41.1 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3922  putative transcriptional regulator  41.1 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0017  hypothetical protein  36.47 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.447593  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3350  putative transcriptional regulator  32.95 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000971437  normal  0.44522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>