More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0402 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
529 aa  1067    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  51 
 
 
427 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  52.02 
 
 
432 aa  385  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  47.41 
 
 
424 aa  357  3.9999999999999996e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  45.14 
 
 
423 aa  318  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  39.95 
 
 
436 aa  257  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  39.6 
 
 
445 aa  171  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  32.45 
 
 
424 aa  169  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  34.53 
 
 
447 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1779  peptidase M48 Ste24p  38.36 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00812626  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  40.74 
 
 
489 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  43.26 
 
 
489 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  39.11 
 
 
453 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  44.29 
 
 
489 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  40.16 
 
 
493 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  37.6 
 
 
492 aa  147  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  32.22 
 
 
442 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  36.96 
 
 
479 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  42.01 
 
 
494 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  39.85 
 
 
504 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  35.95 
 
 
478 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  37.41 
 
 
479 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  37.89 
 
 
513 aa  136  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  34.19 
 
 
489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  38.46 
 
 
365 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  31.44 
 
 
445 aa  130  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  35.74 
 
 
275 aa  127  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  36.22 
 
 
258 aa  127  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  32.4 
 
 
268 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  38.33 
 
 
284 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  34.94 
 
 
479 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  33.45 
 
 
279 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  33.2 
 
 
268 aa  123  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  33.45 
 
 
279 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  35.68 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  36.74 
 
 
285 aa  121  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1890  Zn-dependent protease  33.73 
 
 
273 aa  121  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  33.33 
 
 
262 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  32.69 
 
 
274 aa  119  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  36.07 
 
 
490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  31.68 
 
 
264 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  36.21 
 
 
320 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  32.3 
 
 
263 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  36.87 
 
 
278 aa  116  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  31.86 
 
 
278 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  33.75 
 
 
282 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
275 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  31.85 
 
 
277 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  32.42 
 
 
265 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  37.79 
 
 
286 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
263 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  37.45 
 
 
285 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  32.23 
 
 
284 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  30.65 
 
 
569 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  33.47 
 
 
272 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  29.51 
 
 
265 aa  109  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  31.7 
 
 
561 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  30.65 
 
 
567 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  35.52 
 
 
632 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  33.88 
 
 
474 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  31.13 
 
 
267 aa  108  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  37.16 
 
 
275 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  33.2 
 
 
266 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  32.81 
 
 
266 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  34.04 
 
 
292 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  36.07 
 
 
640 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  32.65 
 
 
268 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  35.52 
 
 
632 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  28.06 
 
 
488 aa  107  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  32.83 
 
 
292 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  36.95 
 
 
483 aa  107  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  31.75 
 
 
487 aa  107  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  34.32 
 
 
269 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  35.71 
 
 
550 aa  107  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  33.99 
 
 
484 aa  106  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  32.53 
 
 
479 aa  106  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  29.51 
 
 
473 aa  106  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  34.32 
 
 
269 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  34.62 
 
 
269 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  30.3 
 
 
262 aa  106  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  32.75 
 
 
259 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  34.32 
 
 
269 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  28.49 
 
 
524 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  28.49 
 
 
494 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  34.78 
 
 
264 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  28.49 
 
 
494 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3335  peptidase M48 Ste24p  34.58 
 
 
474 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  34.92 
 
 
604 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  33.2 
 
 
269 aa  104  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  31.11 
 
 
268 aa  104  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  32.97 
 
 
493 aa  104  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  33.91 
 
 
475 aa  104  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  28.18 
 
 
483 aa  104  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  31.28 
 
 
269 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  32.13 
 
 
478 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  27.2 
 
 
487 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  27.2 
 
 
487 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  27.2 
 
 
487 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  27.2 
 
 
487 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  33.47 
 
 
269 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>