More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0393 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  100 
 
 		 283 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  49.27 
 
 		 279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.36 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  46.24 
 
 		 285 aa  242  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  46.81 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  50.98 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  44.91 
 
 		 288 aa  238  6.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  46.74 
 
 		 287 aa  236  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  45.91 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.98 
 
 		 275 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  49.8 
 
 		 270 aa  236  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  46.84 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  46.36 
 
 		 287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  44.7 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  45.65 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  50.59 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.1 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  45.82 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1530  HemK family modification methylase  47.47 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  45.29 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  45.29 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  45.2 
 
 		 282 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  48.83 
 
 		 274 aa  228  8e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  44.57 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  44.84 
 
 		 282 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  44.84 
 
 		 282 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  45.2 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  47.86 
 
 		 285 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  43.43 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  43.84 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  43.84 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0802  HemK family modification methylase  43.77 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0840455  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  43.01 
 
 		 280 aa  219  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.67 
 
 		 276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  50.98 
 
 		 276 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  43.07 
 
 		 279 aa  218  7e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  49.59 
 
 		 295 aa  218  7e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  45.69 
 
 		 281 aa  218  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  50 
 
 		 276 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  40.94 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  43.48 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  43.12 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  49.17 
 
 		 276 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.17 
 
 		 276 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1930  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.07 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00345869  normal  0.0875835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.96 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  44.4 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.96 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.59 
 
 		 276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2435  modification methylase, HemK family  43.07 
 
 		 277 aa  211  9e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000273113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1376  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.07 
 
 		 277 aa  211  9e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000091189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2414  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.07 
 
 		 277 aa  211  9e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0911991  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1317  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.07 
 
 		 277 aa  211  9e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  50.19 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  42.55 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1360  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.07 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000216637  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2406  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.07 
 
 		 281 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  38.65 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.58 
 
 		 276 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3684  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.03 
 
 		 280 aa  209  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0936698  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  47.66 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01187  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.7 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01197  hypothetical protein  42.7 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337876  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2911  HemK family modification methylase  42.39 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2640  HemK family modification methylase  48.25 
 
 		 286 aa  209  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.718768  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.57 
 
 		 277 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.57 
 
 		 277 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.57 
 
 		 277 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.57 
 
 		 277 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  41.52 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1693  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.32 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  46.27 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.19 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0289  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.76 
 
 		 281 aa  206  4e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  45.49 
 
 		 277 aa  205  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.28 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  39.58 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  44.77 
 
 		 277 aa  198  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3203  HemK family modification methylase  44.36 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  49.62 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  42.65 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  47.19 
 
 		 287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  45.17 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  46.54 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.54 
 
 		 280 aa  192  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  42.64 
 
 		 285 aa  192  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.27 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.4 
 
 		 300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4747  modification methylase HemK  47.5 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0844052  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  43.97 
 
 		 289 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1045  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.49 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2494  modification methylase HemK  45.49 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  46.18 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  46.12 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0948  peptide release factor glutamine N(5)-methylase  38.75 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.7 
 
 		 283 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  43.08 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  45.56 
 
 		 280 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  43.92 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.4 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>