73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0381 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
422 aa  840    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  54.97 
 
 
994 aa  205  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  55.44 
 
 
1219 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  52.71 
 
 
552 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  33.5 
 
 
1621 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  48.53 
 
 
1083 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 
1779 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  42.98 
 
 
1448 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  41.11 
 
 
1711 aa  170  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  44.68 
 
 
393 aa  170  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 
1247 aa  160  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  43.9 
 
 
992 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  49.03 
 
 
1544 aa  140  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  44.12 
 
 
1321 aa  133  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  43.56 
 
 
596 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  38.71 
 
 
476 aa  117  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  39.58 
 
 
599 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  46.15 
 
 
724 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 
1911 aa  109  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  36.82 
 
 
714 aa  103  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  35.74 
 
 
560 aa  94.4  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  31.56 
 
 
1141 aa  90.5  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  30.24 
 
 
934 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  31.39 
 
 
982 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.36 
 
 
644 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  32.98 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  33.52 
 
 
720 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  29.63 
 
 
737 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  33.89 
 
 
1502 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  32.12 
 
 
337 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  31.32 
 
 
326 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  31.32 
 
 
326 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  31.6 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  31.6 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  35.29 
 
 
720 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  29.49 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  32.2 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  29.5 
 
 
490 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  28.71 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  29.44 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  32.69 
 
 
327 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  27.27 
 
 
962 aa  67  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  24.14 
 
 
460 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  31.74 
 
 
425 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0606  hypothetical protein  38.89 
 
 
199 aa  63.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  31.36 
 
 
501 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  32.56 
 
 
416 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  31.49 
 
 
412 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  32.28 
 
 
426 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.78 
 
 
1694 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4853  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
421 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  23.74 
 
 
1266 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  31.79 
 
 
405 aa  53.5  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  33.85 
 
 
521 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  28 
 
 
985 aa  49.7  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  28 
 
 
832 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 
1060 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  30.5 
 
 
445 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 
602 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  23.53 
 
 
1476 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42809  predicted protein  29.41 
 
 
323 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767843  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 
878 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.12 
 
 
636 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  24.68 
 
 
833 aa  47  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.76 
 
 
991 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
718 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  23.48 
 
 
1058 aa  46.6  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.57 
 
 
810 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
649 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  32.29 
 
 
493 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.14 
 
 
1238 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 
512 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  29.37 
 
 
828 aa  43.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>