More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0281 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0281  ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
292 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.63 
 
 
299 aa  324  9e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190071 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06500  carbohydrate ABC transporter membrane protein  58.76 
 
 
321 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.88 
 
 
331 aa  315  6e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.7 
 
 
320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.292649  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.06 
 
 
319 aa  307  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.89 
 
 
318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.05 
 
 
310 aa  299  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.01 
 
 
308 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.01 
 
 
308 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.853442  normal  0.685254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.01 
 
 
308 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172958  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.56 
 
 
310 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.944367  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.88 
 
 
310 aa  292  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0634568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.2 
 
 
388 aa  290  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11261  sugar-transport integral membrane protein ABC transporter sugA  54.39 
 
 
307 aa  290  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00812399 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20480  carbohydrate ABC transporter membrane protein  50.84 
 
 
318 aa  282  6.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0521728  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.4 
 
 
315 aa  278  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.9 
 
 
292 aa  275  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0233696  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.83 
 
 
320 aa  271  9e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158412  hitchhiker  0.000108715 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04590  permease component of ABC-type sugar transporter  50 
 
 
323 aa  259  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359187  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.62 
 
 
310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.4 
 
 
307 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.21 
 
 
299 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.91 
 
 
435 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.61 
 
 
293 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0994152  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.61 
 
 
306 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.61 
 
 
293 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.95 
 
 
427 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000129291  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.65 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.982578  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.01 
 
 
330 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
312 aa  195  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.56 
 
 
296 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
293 aa  192  4e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215175  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
345 aa  192  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.65014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.48 
 
 
291 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00180742  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
300 aa  187  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000378352  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
328 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.236219 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
324 aa  179  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
328 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511246  normal  0.17987 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0305  sugar ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 
325 aa  176  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
315 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
315 aa  176  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273483  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0280  sugar ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 
325 aa  176  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.227719  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
294 aa  172  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
320 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
330 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 
301 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1261  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.97 
 
 
298 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196832  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
355 aa  169  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
320 aa  169  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0272526  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
312 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0761  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.77 
 
 
320 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0629996  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0949  permease protein of sugar ABC transporter  37.99 
 
 
292 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688345  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
338 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0789775 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
297 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2171  carbohydrate ABC transporter permease  39.69 
 
 
280 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0580768  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
345 aa  165  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
286 aa  165  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0548  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpA  35.92 
 
 
288 aa  165  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2083  carbohydrate ABC transporter permease  39.06 
 
 
286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0183943 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.28 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
309 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282921  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
293 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000240561  normal  0.90976 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28370  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.12 
 
 
287 aa  158  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096742  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0888  sugar ABC transporter, permease protein  36.77 
 
 
320 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392731  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
294 aa  156  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
316 aa  155  8e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
312 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130846  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1755  ABC transporter permease  34.48 
 
 
312 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.576454  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
286 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
293 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
286 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.80505  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
286 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524108  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
313 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
313 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
292 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.568052  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
299 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.610005  normal  0.71076 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
323 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
293 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.555685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0144983  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
304 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.707606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
286 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771132  normal  0.363599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
296 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
304 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44429  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.99 
 
 
318 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
318 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
292 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
291 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.257134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 
306 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2900  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
295 aa  142  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
294 aa  142  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>