More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0276 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0276  two component transcription LuxR family regulatory protein  100 
 
 		 224 aa  467  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00306595  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 201 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 205 aa  157  9e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  40.84 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  40.1 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  40.1 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  40.1 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  40.1 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  40.1 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  40.1 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  40.1 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  39.09 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.95 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.59 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 207 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 209 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6853  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.31 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  34.01 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  40.43 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  34.01 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1465  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.27 
 
 		 247 aa  138  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  33.02 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  38.66 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.96 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  36.22 
 
 		 210 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.09 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.09 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.75 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0846  two component LuxR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 209 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  33.16 
 
 		 212 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.23 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.13 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  36.13 
 
 		 198 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2568  response regulator protein  35.71 
 
 		 214 aa  132  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0467638  hitchhiker  0.0000000292578 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  34.2 
 
 		 208 aa  132  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  35.6 
 
 		 215 aa  131  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 216 aa  131  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 211 aa  131  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.29 
 
 		 1445 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5708  two component LuxR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306208 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.85 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 209 aa  128  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2774  LuxR family DNA-binding response regulator  35.38 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  36.27 
 
 		 204 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3794  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  33.68 
 
 		 206 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4829  response regulator receiver protein  36.32 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352064  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  33.51 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 203 aa  125  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4653  two component LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 209 aa  125  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 208 aa  125  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 208 aa  125  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 210 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  33.5 
 
 		 205 aa  125  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  35.79 
 
 		 209 aa  124  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2282  two component LuxR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 199 aa  124  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.17 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  33.33 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  31.66 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>