More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0243 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  100 
 
 		 68 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  75.38 
 
 		 67 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  74.63 
 
 		 75 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  70.59 
 
 		 68 aa  110  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  72.31 
 
 		 72 aa  110  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  70.77 
 
 		 74 aa  107  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  67.16 
 
 		 67 aa  106  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  68.75 
 
 		 68 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  68.75 
 
 		 68 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  67.16 
 
 		 67 aa  103  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  67.19 
 
 		 70 aa  103  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  66.18 
 
 		 73 aa  102  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0704  50S ribosomal protein L31  64.71 
 
 		 75 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0686  50S ribosomal protein L31  64.71 
 
 		 75 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  65.15 
 
 		 70 aa  102  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  62.5 
 
 		 79 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  62.5 
 
 		 79 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4365  50S ribosomal protein L31  67.19 
 
 		 70 aa  101  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  63.64 
 
 		 70 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  60.29 
 
 		 77 aa  101  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  64.71 
 
 		 72 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  64.06 
 
 		 74 aa  100  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0536  50S ribosomal protein L31  61.54 
 
 		 70 aa  100  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  65.62 
 
 		 69 aa  100  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4027  50S ribosomal protein L31  67.69 
 
 		 74 aa  100  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  62.69 
 
 		 66 aa  99.4  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0381  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 70 aa  99.4  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 70 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  61.54 
 
 		 73 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3776  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 70 aa  99  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653741  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 71 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0553  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 70 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 70 aa  98.6  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 70 aa  98.2  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0401  50S ribosomal protein L31  66.15 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3354  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 70 aa  98.2  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 70 aa  98.6  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5786  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 71 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66710  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 71 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0477  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 70 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0501  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 70 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0498  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 70 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3842  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 70 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 71 aa  97.4  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3493  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 70 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0459  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 70 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3670  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 70 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 		 66 aa  97.1  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03821  50S ribosomal subunit protein L31  59.09 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4049  ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 65 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4082  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4168  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4378  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427206 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03770  hypothetical protein  59.09 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0378  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 71 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4419  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4472  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5394  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.948116  normal  0.943424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 65 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3645  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 		 74 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4960  ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 100 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  60.87 
 
 		 75 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0640  50S ribosomal protein L31P  65.15 
 
 		 86 aa  95.5  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.045358 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  60.94 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5087  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 71 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5137  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 71 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0118  ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 71 aa  94.4  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  63.08 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2693  50S ribosomal protein L31  60.94 
 
 		 70 aa  94.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000422577  hitchhiker  0.00222297 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  63.08 
 
 		 66 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 70 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  53.73 
 
 		 66 aa  93.6  7e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0184  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 71 aa  93.6  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18350  LSU ribosomal protein L31P  60.87 
 
 		 71 aa  93.6  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.888151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1655  50S ribosomal protein L31  60.87 
 
 		 72 aa  93.6  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  60.87 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19250  LSU ribosomal protein L31P  63.24 
 
 		 71 aa  92.8  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.464587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1888  50S ribosomal protein L31  64.29 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0909823  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 80 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0887  50S ribosomal protein L31  60.87 
 
 		 75 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4788  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 71 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000702878 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 		 75 aa  92.8  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  59.42 
 
 		 75 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29920  LSU ribosomal protein L31P  62.12 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.568534 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1087  ribosomal protein L31  60.87 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0170  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 71 aa  92  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4426  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 70 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4342  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 70 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4312  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 70 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09910  LSU ribosomal protein L31P  62.86 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4496  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 70 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4428  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 70 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4149  ribosomal protein L31  57.97 
 
 		 74 aa  92  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  55.22 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  57.35 
 
 		 74 aa  91.3  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>