66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0210 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  965    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  38.39 
 
 		 714 aa  150  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  38.67 
 
 		 596 aa  141  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  41.25 
 
 		 599 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  39 
 
 		 724 aa  137  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  31.93 
 
 		 552 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 994 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  37.5 
 
 		 1219 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 		 1621 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  43.24 
 
 		 1141 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  37.45 
 
 		 1779 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 		 422 aa  117  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  32.07 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  36.61 
 
 		 1448 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  36.33 
 
 		 1083 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  32.64 
 
 		 560 aa  98.2  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 		 1711 aa  94.4  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  34.82 
 
 		 1544 aa  84.7  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  33.74 
 
 		 1247 aa  80.5  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 1502 aa  80.1  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 1911 aa  77.4  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  28.8 
 
 		 992 aa  73.6  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.86 
 
 		 632 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 		 1869 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 1321 aa  67.8  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.87 
 
 		 644 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 		 543 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 878 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  30.06 
 
 		 982 aa  57.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  24.04 
 
 		 934 aa  57.4  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  24.18 
 
 		 764 aa  57  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  24.48 
 
 		 445 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  21.51 
 
 		 810 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  21.75 
 
 		 490 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  29.9 
 
 		 326 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 3172 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  31.76 
 
 		 326 aa  54.7  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  31.76 
 
 		 326 aa  54.7  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  28.18 
 
 		 322 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  28.18 
 
 		 322 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.26 
 
 		 725 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  27.71 
 
 		 501 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1864  hypothetical protein  35.77 
 
 		 682 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.837746  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.62 
 
 		 887 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 681 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25.08 
 
 		 875 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  24.48 
 
 		 341 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.94 
 
 		 1694 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  27.72 
 
 		 720 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.37 
 
 		 3301 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  24.29 
 
 		 720 aa  47  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  24.87 
 
 		 325 aa  47  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  22.31 
 
 		 603 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 3145 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  25.78 
 
 		 337 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  30.64 
 
 		 572 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  33.33 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 637 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 718 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 687 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  26.61 
 
 		 327 aa  44.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  28.57 
 
 		 325 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  25.89 
 
 		 332 aa  43.9  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.23 
 
 		 397 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  26.32 
 
 		 682 aa  43.9  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  28.81 
 
 		 677 aa  43.1  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>