More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0209 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0209  exodeoxyribonuclease III xth  100 
 
 		 237 aa  489  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  67.8 
 
 		 255 aa  337  8e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  63.14 
 
 		 256 aa  321  6e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  60.5 
 
 		 258 aa  311  7.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  60.34 
 
 		 255 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  58.62 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  56.22 
 
 		 267 aa  285  5.999999999999999e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  57.76 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  55.27 
 
 		 277 aa  278  8e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  54.01 
 
 		 255 aa  275  6e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  56.33 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  56.33 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  52.52 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  51.9 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03249  exodeoxyribonuclease III  52.77 
 
 		 259 aa  261  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  48.52 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  51.28 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  52.79 
 
 		 254 aa  255  4e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  50.21 
 
 		 274 aa  254  9e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  51.3 
 
 		 265 aa  252  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  50.87 
 
 		 258 aa  250  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  49.57 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  46.67 
 
 		 257 aa  249  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.645227  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  48.32 
 
 		 322 aa  248  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  51.25 
 
 		 254 aa  248  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  47.72 
 
 		 258 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  47.72 
 
 		 258 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  47.72 
 
 		 258 aa  248  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  47.72 
 
 		 258 aa  248  8e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  47.72 
 
 		 258 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  47.72 
 
 		 258 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  48.77 
 
 		 261 aa  247  9e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  47.72 
 
 		 258 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  47.48 
 
 		 258 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  48.32 
 
 		 258 aa  245  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  50.87 
 
 		 275 aa  245  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  47.7 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  48.32 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  47.3 
 
 		 258 aa  242  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  47.68 
 
 		 260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  47.3 
 
 		 258 aa  240  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  47.3 
 
 		 258 aa  240  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  47.06 
 
 		 258 aa  239  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  47.06 
 
 		 258 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  47.06 
 
 		 258 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  47.06 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  46.47 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  47.06 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  46.47 
 
 		 260 aa  238  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  48.1 
 
 		 261 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  46.86 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  46.86 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  50 
 
 		 257 aa  234  8e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  50 
 
 		 257 aa  234  8e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  46.94 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  45.2 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  46.94 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  48.37 
 
 		 288 aa  231  7.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.60209 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  46.09 
 
 		 260 aa  229  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  48.54 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  46.58 
 
 		 269 aa  226  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  46.91 
 
 		 265 aa  226  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1252  exodeoxyribonuclease III Xth  45.56 
 
 		 282 aa  225  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010877  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  43.8 
 
 		 281 aa  224  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  45.73 
 
 		 269 aa  222  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  43.39 
 
 		 281 aa  221  6e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  45.73 
 
 		 269 aa  221  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  42.56 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  42.74 
 
 		 275 aa  211  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  40.08 
 
 		 281 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  43.83 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  42.74 
 
 		 275 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  45.23 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  43.98 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  43.7 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  42.49 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1180  exodeoxyribonuclease III  42.02 
 
 		 264 aa  194  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  39.26 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  40.25 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  40.85 
 
 		 254 aa  182  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  38.43 
 
 		 263 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  37.7 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  37.55 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1727  exodeoxyribonuclease III Xth  40.5 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  40.17 
 
 		 259 aa  178  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0692  exodeoxyribonuclease III  37.13 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000190547  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0660  exodeoxyribonuclease III  37.13 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969043  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0470  exodeoxyribonuclease III Xth  40.83 
 
 		 289 aa  176  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  38.98 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  38.56 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  36.4 
 
 		 279 aa  175  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  40.17 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  38.66 
 
 		 265 aa  175  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  36.59 
 
 		 266 aa  174  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  39.42 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  35.98 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  39 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  37.19 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2815  exodeoxyribonuclease III  38.72 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0879261  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  39 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>