More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0148 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 213 aa  441  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  73.58 
 
 		 227 aa  324  5e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  64.79 
 
 		 213 aa  289  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  66.35 
 
 		 215 aa  287  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  63.85 
 
 		 233 aa  287  8e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  64.32 
 
 		 213 aa  287  8e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  64.32 
 
 		 213 aa  287  8e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  64.45 
 
 		 217 aa  286  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  64.45 
 
 		 217 aa  286  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  65.09 
 
 		 215 aa  285  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  66.67 
 
 		 226 aa  285  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  65.57 
 
 		 264 aa  285  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  64.29 
 
 		 216 aa  284  5.999999999999999e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  61.61 
 
 		 217 aa  281  5.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  64.93 
 
 		 215 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  64.93 
 
 		 215 aa  280  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  64.93 
 
 		 215 aa  280  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  65.71 
 
 		 214 aa  279  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  65.71 
 
 		 214 aa  279  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  63.98 
 
 		 232 aa  279  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  63.51 
 
 		 212 aa  278  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  63.81 
 
 		 234 aa  276  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  61.14 
 
 		 217 aa  275  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  64.45 
 
 		 215 aa  275  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  64.45 
 
 		 215 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  65.07 
 
 		 215 aa  269  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  63.33 
 
 		 216 aa  269  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  63.98 
 
 		 215 aa  268  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  58.57 
 
 		 212 aa  258  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  61.14 
 
 		 223 aa  256  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  57.14 
 
 		 227 aa  241  5e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  63.02 
 
 		 193 aa  237  9e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  51.56 
 
 		 244 aa  230  1e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  50.67 
 
 		 245 aa  229  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  51.11 
 
 		 244 aa  227  9e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  48.06 
 
 		 215 aa  197  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  48.1 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  45.45 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  45.33 
 
 		 223 aa  191  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  45.07 
 
 		 222 aa  189  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  45.41 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  45.89 
 
 		 210 aa  187  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  46.45 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  44.44 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  44.39 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  44.44 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  44.76 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  44.08 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  40.48 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  40.76 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  40.09 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  35.55 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  37.38 
 
 		 209 aa  154  8e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  41.18 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  41.09 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  39.9 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  40.1 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  37.39 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  40.2 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  30.25 
 
 		 258 aa  92.8  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  45.1 
 
 		 280 aa  92.4  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  31.22 
 
 		 258 aa  92.4  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  38.24 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  34.1 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  38.6 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  28.92 
 
 		 195 aa  87.8  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  44.23 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  41.51 
 
 		 274 aa  86.3  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  32.73 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  30.88 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  32.42 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  28.85 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  39.6 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  25.12 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  25.94 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  29.26 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  29.8 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  37.76 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  28.23 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  26.36 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  28.5 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  28.33 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  31.13 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  28.14 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  26.17 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  29.36 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  28.68 
 
 		 244 aa  72  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  24.89 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  28.76 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0734  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  27.71 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0750  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  27.35 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>