More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0143 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 148 aa  291  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.42 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  51.85 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.86 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  51.45 
 
 		 142 aa  140  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.82 
 
 		 140 aa  140  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  49.3 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  49.3 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  51.8 
 
 		 141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.79 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.52 
 
 		 145 aa  137  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  51.49 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  48.28 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  48.28 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  48.97 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  48.97 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.36 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.72 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.72 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.65 
 
 		 144 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.76 
 
 		 142 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  45.99 
 
 		 144 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.99 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  47.41 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  45.99 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1275  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.89 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.146064  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  45.99 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.53 
 
 		 144 aa  124  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.99 
 
 		 144 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.65 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  45.99 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36660  TolR protein  48.63 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0583237  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  44.06 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.57 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  43.48 
 
 		 145 aa  120  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  48.06 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  47.01 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  48.09 
 
 		 150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  45.89 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  44.9 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  45.89 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.9 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.84 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  45.89 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  45.89 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  45.32 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  43.61 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.53 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.603451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  42.03 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  42.11 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  47.41 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  47.41 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  45.8 
 
 		 151 aa  110  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0896  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.95 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238629  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.03 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.72 
 
 		 147 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1135  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 		 152 aa  106  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  38.97 
 
 		 139 aa  104  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  37.06 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  40.29 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  43.7 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.97 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.13 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  40.6 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  36.69 
 
 		 141 aa  100  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.04 
 
 		 139 aa  100  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  38.57 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1896  TolR protein, membrane component  40.69 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  35.88 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.08 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2716  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.07 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0557943  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  35.71 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1431  tolR membrane protein  37.14 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.87088e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  36.43 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003915  Tol biopolymer transport system TolR protein  39.44 
 
 		 147 aa  95.9  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0762164  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0947  protein TolR  37.14 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.324869  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  38.46 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  40.62 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.4 
 
 		 131 aa  94.7  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.73 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.55 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3412  biopolymer transport protein ExbD  40.62 
 
 		 141 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  36.57 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3332  biopolymer transport protein ExbD  40.62 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3507  biopolymer transport protein ExbD  40.62 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  40.62 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 		 143 aa  93.6  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.37 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01608  hypothetical protein  39.16 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  35.11 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1375  tolR protein  38.03 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103721  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  35.38 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  36.72 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  36.72 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  36.64 
 
 		 146 aa  92.8  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  38.35 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.75 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  38.85 
 
 		 138 aa  92.8  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.69 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>