25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0102 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0102  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.653521  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2062  CBS domain protein  42.71 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.628455  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1720  putative signal-transduction protein with CBS domains  42.71 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.346801 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2064  hypothetical protein  44.51 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0577346  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0664  hypothetical protein  40.51 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.358372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0342  CBS domain containing protein  44.38 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0061  CBS domain containing protein  41.67 
 
 		 201 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2957  CBS domain-containing protein  39.68 
 
 		 196 aa  131  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0454  CBS  40.53 
 
 		 218 aa  128  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1893  CBS  41.18 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1857  CBS domain-containing protein  36.84 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0333  CBS domain-containing protein  36.26 
 
 		 197 aa  112  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2035  hypothetical protein  33.94 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2459  CBS domain-containing protein  34.44 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03825  CBS domain protein  30.67 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3704  signal transduction protein  32.89 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000122502  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2693  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1349  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.735809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1518  CBS domain-containing protein  27.33 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000300284  hitchhiker  0.000492354 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1244  CBS domain-containing protein  28.29 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2237  CBS domain-containing protein  26.01 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.303434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3813  hypothetical protein  23.84 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00350231  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4280  hypothetical protein  26.32 
 
 		 251 aa  52  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  40.68 
 
 		 154 aa  41.2  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  40.68 
 
 		 154 aa  41.2  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>