260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0089 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0089  nitrite reductase (NO-forming)  100 
 
 		 372 aa  769    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  62.84 
 
 		 391 aa  448  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  63.47 
 
 		 370 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  61.03 
 
 		 392 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  61.09 
 
 		 393 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  61.21 
 
 		 367 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  61.19 
 
 		 376 aa  428  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  60.06 
 
 		 376 aa  412  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  58.13 
 
 		 364 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  60.71 
 
 		 369 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  60.42 
 
 		 376 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  57.73 
 
 		 374 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  60.06 
 
 		 376 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  57.35 
 
 		 366 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  36.22 
 
 		 510 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  33.43 
 
 		 534 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  35.96 
 
 		 499 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  35.96 
 
 		 499 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  33.9 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.05 
 
 		 516 aa  153  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  35.74 
 
 		 516 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  35.74 
 
 		 520 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  35.74 
 
 		 520 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  35.74 
 
 		 520 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  35.74 
 
 		 520 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  35.74 
 
 		 520 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  35.74 
 
 		 520 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  34.32 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  35.77 
 
 		 348 aa  146  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  33.11 
 
 		 481 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  31.82 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  30.55 
 
 		 362 aa  143  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  32.54 
 
 		 350 aa  142  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  31.34 
 
 		 479 aa  139  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  34.13 
 
 		 466 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  29.53 
 
 		 451 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  33.33 
 
 		 358 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  28.42 
 
 		 857 aa  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  30.77 
 
 		 463 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  28.72 
 
 		 856 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  29.07 
 
 		 323 aa  97.8  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  27.47 
 
 		 470 aa  97.1  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  28.33 
 
 		 455 aa  96.3  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  27.67 
 
 		 470 aa  93.6  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  27.27 
 
 		 526 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  28.12 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  28.99 
 
 		 876 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  29.41 
 
 		 952 aa  90.9  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  27.97 
 
 		 314 aa  90.5  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  24.14 
 
 		 487 aa  90.1  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  27.6 
 
 		 912 aa  89.7  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  27.9 
 
 		 471 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  28.06 
 
 		 911 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  24.39 
 
 		 535 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  26.79 
 
 		 878 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  24.39 
 
 		 535 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  24.04 
 
 		 487 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  26.07 
 
 		 486 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.69 
 
 		 535 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  23.69 
 
 		 535 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.69 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.69 
 
 		 535 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  35.66 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  24.83 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  27.57 
 
 		 479 aa  79.7  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  30.34 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  29.22 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  30.89 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  26.07 
 
 		 969 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  35.54 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  39.81 
 
 		 576 aa  71.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  32.8 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  29.73 
 
 		 581 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  31.58 
 
 		 656 aa  67.4  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  26.99 
 
 		 546 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  27.09 
 
 		 565 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  32 
 
 		 561 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  27.88 
 
 		 544 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  31.3 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  25.11 
 
 		 526 aa  65.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  26.99 
 
 		 546 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  28.05 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  29.45 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  28.05 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  27.07 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  26.69 
 
 		 514 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  34.58 
 
 		 579 aa  62.8  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  31.41 
 
 		 549 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  34.92 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  30.41 
 
 		 505 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  35.61 
 
 		 364 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  33.64 
 
 		 627 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  33.86 
 
 		 626 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  30.26 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  33.6 
 
 		 633 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  29.63 
 
 		 589 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  31.54 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  30.26 
 
 		 604 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  31.76 
 
 		 592 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  32.8 
 
 		 630 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>