36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0059 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  47.25 
 
 		 920 aa  855    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0059  hypothetical protein  100 
 
 		 947 aa  1987    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  47.25 
 
 		 920 aa  855    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  42.04 
 
 		 852 aa  691    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  51.54 
 
 		 1068 aa  1051    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1119  hypothetical protein  52.38 
 
 		 1030 aa  1062    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327751 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  48.53 
 
 		 992 aa  895    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  28.82 
 
 		 599 aa  231  7e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  25.98 
 
 		 596 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  22.6 
 
 		 540 aa  99.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1071 aa  71.2  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  34.68 
 
 		 1045 aa  68.9  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.55 
 
 		 739 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1118 aa  67  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  23.83 
 
 		 916 aa  63.9  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1070 aa  62.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  26.23 
 
 		 751 aa  55.5  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  23.81 
 
 		 610 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  20.07 
 
 		 936 aa  53.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  23.57 
 
 		 894 aa  52  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  21.82 
 
 		 747 aa  51.6  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  25.45 
 
 		 737 aa  50.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  23.94 
 
 		 934 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3656  adenine specific DNA methylase Mod  30.93 
 
 		 567 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000129355  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1106 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1279 aa  48.9  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0950  hypothetical protein  19.39 
 
 		 501 aa  48.5  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52350  adenine specific DNA methylase N-4/N-6  40.38 
 
 		 560 aa  46.6  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.46 
 
 		 382 aa  45.8  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  19.52 
 
 		 995 aa  45.8  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  24 
 
 		 651 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  21.13 
 
 		 892 aa  45.4  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  22.94 
 
 		 703 aa  45.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3803  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  38.46 
 
 		 566 aa  44.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  20.59 
 
 		 911 aa  44.7  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  20.59 
 
 		 911 aa  44.7  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>