More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0046 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  100 
 
 
251 aa  520  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  68.8 
 
 
353 aa  353  1e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  45.25 
 
 
334 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  38.7 
 
 
367 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  36.95 
 
 
337 aa  152  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  36 
 
 
429 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  37.5 
 
 
359 aa  142  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  39.08 
 
 
413 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  41.55 
 
 
330 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  36.44 
 
 
347 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  36.44 
 
 
347 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  36.67 
 
 
222 aa  136  3e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  35.39 
 
 
351 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  39.34 
 
 
402 aa  135  7e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.73566e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  36.44 
 
 
351 aa  134  2e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  36.94 
 
 
380 aa  130  1e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  34.68 
 
 
404 aa  131  1e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  33.73 
 
 
421 aa  130  2e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  34.33 
 
 
386 aa  127  2e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  34.5 
 
 
354 aa  127  2e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  32.89 
 
 
388 aa  121  1e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  34.17 
 
 
412 aa  120  2e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  34.68 
 
 
374 aa  119  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  34.45 
 
 
379 aa  119  4e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  36.48 
 
 
369 aa  119  5e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  36.48 
 
 
369 aa  119  5e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  36.48 
 
 
369 aa  119  5e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  32.33 
 
 
375 aa  119  5e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  36.41 
 
 
354 aa  119  5e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  36.41 
 
 
354 aa  119  5e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  36.48 
 
 
369 aa  119  5e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  38.35 
 
 
338 aa  119  5e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  33.61 
 
 
374 aa  117  2e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  33.92 
 
 
337 aa  117  2e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  34.15 
 
 
412 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  35.19 
 
 
395 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  35.92 
 
 
327 aa  115  7e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  34.72 
 
 
366 aa  115  7e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  34.26 
 
 
276 aa  114  2e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  36.32 
 
 
396 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  30.51 
 
 
387 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  34.74 
 
 
328 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  32.77 
 
 
374 aa  111  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  35.38 
 
 
482 aa  110  2e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  36.96 
 
 
340 aa  109  4e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  37.33 
 
 
356 aa  109  4e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  32.91 
 
 
323 aa  109  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  31.3 
 
 
387 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  8.19042e-09 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  31.48 
 
 
387 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  30.56 
 
 
387 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  30.36 
 
 
384 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  33.64 
 
 
340 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.07497e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  29.57 
 
 
387 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  32.22 
 
 
334 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  29.57 
 
 
387 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  33.03 
 
 
341 aa  102  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  31.65 
 
 
324 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  34.13 
 
 
393 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  32.91 
 
 
347 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  33.19 
 
 
369 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  31.17 
 
 
397 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  27.62 
 
 
401 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  40.41 
 
 
159 aa  99.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  29.82 
 
 
387 aa  99  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  39.49 
 
 
172 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  31.75 
 
 
390 aa  98.6  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  36.17 
 
 
188 aa  98.6  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  30.14 
 
 
387 aa  98.6  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  36.57 
 
 
425 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  33.18 
 
 
332 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  31.42 
 
 
386 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  30.8 
 
 
332 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  31.19 
 
 
349 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  28.09 
 
 
348 aa  96.3  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  29.6 
 
 
338 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25.88 
 
 
337 aa  94.7  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  30.7 
 
 
331 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  33.65 
 
 
327 aa  90.5  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  32.55 
 
 
274 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  33.33 
 
 
397 aa  90.5  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  31.13 
 
 
400 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  9.71423e-06 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  31.78 
 
 
384 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  32.86 
 
 
414 aa  89.4  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.30336e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  30.09 
 
 
339 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  32.61 
 
 
411 aa  89  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  28.4 
 
 
381 aa  88.6  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  28.69 
 
 
368 aa  87.8  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  28.92 
 
 
426 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  33.81 
 
 
343 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  31.75 
 
 
335 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  32.72 
 
 
334 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  30.59 
 
 
339 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  28.57 
 
 
431 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  28.57 
 
 
398 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  28.24 
 
 
531 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  29.13 
 
 
365 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  29.55 
 
 
363 aa  86.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  29.2 
 
 
434 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  30.12 
 
 
341 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  32.91 
 
 
451 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>