52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0025 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0025  formylmethanofuran dehydrogenase  100 
 
 		 425 aa  878    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2860  formylmethanofuran dehydrogenase  50.12 
 
 		 423 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.807809  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1662  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  48.07 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130611  normal  0.319857 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2623  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  36.93 
 
 		 423 aa  227  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5935  formylmethanofuran dehydrogenase  33.66 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911434  normal  0.0527378 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2461  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  34.97 
 
 		 466 aa  210  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3067  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  32.93 
 
 		 410 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1796  formylmethanofuran dehydrogenase  34.13 
 
 		 440 aa  196  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00519016  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6504  formyltransferase/hydrolase complex subunit B(FhcB)  32.63 
 
 		 469 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0374331 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2400  tungsten-containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  31.78 
 
 		 369 aa  190  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0980  molybdopterin oxidoreductase  27.94 
 
 		 434 aa  169  6e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0412104  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0966  tungsten containing formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  27.94 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0993  molybdopterin oxidoreductase  28.07 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1715  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  27.48 
 
 		 437 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3136  formylmethanofuran dehydrogenase  31.22 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0526  tungsten-containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  30.41 
 
 		 356 aa  142  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.675235 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1983  molybdopterin oxidoreductase  26.03 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0067  molybdopterin oxidoreductase  25.06 
 
 		 434 aa  141  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.589018  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2235  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  25.49 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.291466  normal  0.0456097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2108  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  25.4 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0620  molybdopterin oxidoreductase  26.09 
 
 		 437 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.475538  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1096  molybdopterin oxidoreductase  24.29 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  25.64 
 
 		 587 aa  130  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  25.41 
 
 		 574 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0244  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  26.2 
 
 		 438 aa  127  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.833805  normal  0.256127 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0372  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  26.04 
 
 		 456 aa  126  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0100  molybdopterin oxidoreductase  24.94 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.193455  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0085  molybdopterin oxidoreductase  24.75 
 
 		 447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1187  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  26.89 
 
 		 429 aa  120  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.639664  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0380  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  23.08 
 
 		 443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1449  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  23.76 
 
 		 442 aa  114  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6000  tungsten-containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  31.93 
 
 		 356 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164636  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1994  molybdopterin oxidoreductase  24.94 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0821862  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1532  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  22.58 
 
 		 443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00478576 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1988  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  23.8 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.209103  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1471  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  23.91 
 
 		 461 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0281  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  23.84 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0203  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  25.55 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1462  molybdopterin oxidoreductase  23.17 
 
 		 434 aa  106  7e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1664  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  22.66 
 
 		 442 aa  106  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.827559  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1778  tungsten-containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  28.08 
 
 		 358 aa  106  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.074485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1827  tungsten-containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  27.74 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2162  tungsten-containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  27.42 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.0910953 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1292  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  23.17 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.646537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1763  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  22.38 
 
 		 470 aa  103  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0877  molybdopterin oxidoreductase  22.88 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0977  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  25.35 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1560  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  21.53 
 
 		 454 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2299  Formylmethanofuran dehydrogenase subunit B-like protein  24.41 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122072  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0336  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  22.42 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2922  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  23.08 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113805  hitchhiker  0.00114048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5776  tungsten-containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  30.16 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>