44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0024 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  73.01 
 
 
555 aa  853    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 
556 aa  1157    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  57.61 
 
 
561 aa  654    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  57.04 
 
 
566 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  68.9 
 
 
558 aa  811    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  58.23 
 
 
566 aa  681    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  57.67 
 
 
562 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  55.23 
 
 
561 aa  637    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  56.7 
 
 
561 aa  653    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  59.26 
 
 
549 aa  638    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  53.16 
 
 
572 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  49.62 
 
 
542 aa  514  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  44.18 
 
 
552 aa  471  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  42.7 
 
 
543 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  42.06 
 
 
567 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  41.04 
 
 
548 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  41.34 
 
 
567 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  42.14 
 
 
548 aa  422  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  42.51 
 
 
548 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  41.96 
 
 
548 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  42.44 
 
 
543 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  40.61 
 
 
567 aa  415  1e-114  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  40.9 
 
 
566 aa  410  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  42.24 
 
 
567 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  37.04 
 
 
583 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.87 
 
 
583 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  36.17 
 
 
583 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  37.7 
 
 
566 aa  380  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  36.52 
 
 
583 aa  382  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  37.23 
 
 
566 aa  376  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  36.52 
 
 
565 aa  376  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  36.4 
 
 
582 aa  374  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  37.57 
 
 
570 aa  365  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  38.19 
 
 
570 aa  364  2e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  34.97 
 
 
584 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  33.73 
 
 
597 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  36.84 
 
 
568 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  35.86 
 
 
568 aa  353  7e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  36.61 
 
 
566 aa  352  8e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  34.37 
 
 
584 aa  351  2e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  35.56 
 
 
570 aa  342  9e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  35.23 
 
 
578 aa  342  1e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  35.98 
 
 
571 aa  342  1e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.12 
 
 
569 aa  335  1e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>